MeRIPseq - MeRIPseq

MeRIPseq [1] znamená methylovaný Imunoprecipitace RNA sekvenování, což je metoda detekce post-transkripce RNA modifikace. Nazývá se také m6A-seq.[2]

Variaci metody MerIP-seq vytvořil Benjamin Delatte a kolegové v roce 2016. Tato varianta, zvaná hMerIP-seq (imunoprecipitace hydroxymethylcytosin RNA), používá protilátku, která specificky rozpoznává 5-hydroxymethylcytosin, modifikovanou RNA bázi ovlivňující in vitro překlad a vývoj mozku v Drosophila.[3]

Reference

  1. ^ Meyer, Kate D .; Saletore, Yogesh; Zumbo, Paul; Elemento, Olivier; Mason, Christopher E .; Jaffrey, Samie R. (31. května 2012). „Komplexní analýza methylace mRNA odhaluje obohacení ve 3 'UTR a blízko stop kodonů“. Buňka. 149 (7): 1635–1646. doi:10.1016 / j.cell.2012.05.003. PMC  3383396. PMID  22608085.
  2. ^ Dominissini, Dan; Moshitch-Moshkovitz, Sharon; Schwartz, Schraga; Salmon-Divon, Mali; Ungar, Lior; Osenberg, Sivan; Cesarkas, Karen; Jacob-Hirsch, Jasmine; Amariglio, Ninette; Kupiec, Martin; Sorek, Rotem; Rechavi, Gideon (28. dubna 2012). "Topologie lidských a myších m6A RNA methylomů odhalená m6A-seq". Příroda. 485 (7397): 201–206. Bibcode:2012Natur.485..201D. doi:10.1038 / příroda11112. PMID  22575960. S2CID  3517716.
  3. ^ Delatte, Benjamin (2016). „Transcriptome-wide distribution and function of RNA hydroxymethylcytosine“. Věda. 351 (6270): 282–285. Bibcode:2016Sci ... 351..282D. doi:10.1126 / science.aac5253. PMID  26816380.