MassMatrix - MassMatrix

MassMatrix je hmotnostní spektrometrie analýza dat software, který používá statistický model k dosažení vyšší přesnosti hmotnosti oproti jiným algoritmům prohledávání databáze.[1] Tento vyhledávač je oddělený od ostatních kvůli své schopnosti poskytovat extrémně efektivní úsudek mezi skutečnými a falešnými poplachy pro data s vysokou přesností hmotnosti, která byla získána z dnešních přístrojů hmotnostního spektrometru. Je to užitečné pro identifikaci disulfidových vazeb v datech tandemové hmotnostní spektrometrie.[2] Tento vyhledávač je oddělený od ostatních díky své schopnosti poskytovat extrémně efektivní úsudek mezi skutečnými a falešnými poplachy pro údaje o vysoké hmotnostní přesnosti, které byly získány z dnešních přístrojů hmotnostního spektrometru.[3]

Reference

  1. ^ Xu H, Zhang L, Freitas MA (leden 2008). "Identifikace a charakterizace disulfidových vazeb v proteinech a peptidech z tandemových dat MS pomocí vyhledávače MassMatrix MS / MS". Journal of Proteome Research. 7 (1): 138–44. doi:10.1021 / pr070363z. PMC  2749473. PMID  18072732.
  2. ^ Xu H, Freitas MA (červenec 2008). „Simulační algoritmy Monte Carlo pro analýzu proteomických dat brokovnice“. Journal of Proteome Research. 7 (7): 2605–15. doi:10.1021 / pr800002u. PMC  2749500. PMID  18543962.
  3. ^ Xu, Hua; Hsu, Pang-Hung; Zhang, Liwen; Tsai, Ming-Daw; Freitas, Michael A. (2010-07-02). „Algoritmus vyhledávání v databázi pro identifikaci neporušených křížových vazeb v proteinech a peptidech pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie“. Journal of Proteome Research. 9 (7): 3384–3393. doi:10.1021 / pr100369y. ISSN  1535-3893. PMC  4141472. PMID  20469931.