Lorena S. Beese - Lorena S. Beese

Lorena Beese je profesorem biochemie Jamese B. Dukeho na Duke University. Doktorát z biofyziky získala z Brandeis University a postdoktorandskou práci absolvovala u doktora Thomase A. Steitze na Yale University. V roce 2009 byl Dr. Beese zvolen do Národní akademie věd.^[1]

Mezi výzkumné zájmy Beese patří strukturní biochemie replikace DNA a oprava nesouladu lidské DNA a její spojení s karcinogenezí. Zajímá se také o proteinylové prenylační enzymy jako cíle strukturního objevu protinádorových terapeutik a opětovného použití těchto terapeutik k léčbě patogenních hub a malárie.^[2]

Kariéra

V roce 2008 Beese zveřejnila svůj výzkum na Candida albicans struktura proteinu geranylgeranyltransferáza-1 (GGTáza-1).^[3] Candida albicans je oportunní patogen běžně vyskytující se v lidské mikroflóře. U imunokompromitovaného jedince Candida albicans vést k infekcím, které vykazují rezistenci k antifungálním terapiím.^[4] Vyšetřování a objev struktury GGTas-1 z Candida albicans poskytuje více informací pro vědce, aby pochopili důležitost proteinu pro přežití patogenu a navrhuje jeho potenciál, který má být zaměřen na léčbu nemoci.^[3]

Zatímco na Duke University v roce 2011, Beese spolu se svým kolegou Eugenem Wuem zkoumali strukturální adaptaci DNA polymerázy pozorovanou během rozpoznávání a korekce nesprávného párování bází. Její nálezy zahrnovaly přechodný stav mezi charakteristickými „otevřenými“ a „uzavřenými“ stavy polymerázy během replikace DNA. Tento prostředník byl označen jako potvrzení „Ajar“. Beese zjistil, že vložení nesprávného nukleotidu do rostoucí DNA způsobilo ohyb v helikáze DNA polymerázy. Toto zjištění naznačuje mechanismus, kterým jsou polymerázy schopné detekovat nesprávné párování bází.^[5]

Beese měl nedílnou roli při identifikaci mechanismu opravy nesouladu, kterým hExo1 identifikuje poškození DNA. Za účelem zachování integrity DNA opravují enzymy, jako je lidská exonukleáza 1 (hExo1), poškození DNA. Prostřednictvím svého výzkumu Beese zjistila, že enzym hExo1 váže DNA poblíž místa neshodujícího se párování a prostřednictvím aktivity exonukleázy a endonukleázy je enzym schopen pomoci při identifikaci a nahrazení nesprávných párů bází.^[6]

Mezi výzkumné zájmy Beese patří:

• Transdukce signálu
• Strukturovaný design léčiv
• replikace DNA
• Oprava nesouladu DNA
• Pozorování enzymů v akci

Vybraná díla

• Orans, J. McSweeney; Iyer, R.R .; Hast, M.A.; Hellinga, HW .; Modrich, P .; Beese, L.S. (2011). „Struktura komplexů DNA lidské exonukleázy 1 naznačuje jednotný mechanismus pro rodinu nukleáz. Buňka. 145 (2): 212–223. doi:10.1016 / j.cell.2011.03.005. PMC  3093132. PMID  21496642.
• Wu, E.Y .; Beese, L.S. (2011). „Struktura vysoce věrné DNA polymerázy navázané na neodpovídající nukleotid odhaluje pootevřenou střední konformaci v mechanismu selekce nukleotidů“. J Biol Chem. 286 (22): 19758–67. doi:10.1074 / jbc.M110.191130. PMC  3103354. PMID  21454515.
• Hast, M. A.; Fletcher, S .; Cummings, C.G .; Pusateri, E.E .; Blaskovich, M. A.; Rivas, K .; Gelb, M.H .; Van Voorhis, C.V .; Sebti, S.M .; Hamilton, A.D .; Beese, L.S. (2009). „Strukturální základ pro vazbu a selektivitu antimalarických a protirakovinných inhibitorů ethylendiaminu na protein farnesyltransferázu“. Chemie a biologie. 16 (2): 181–192. doi:10.1016 / j.chembiol.2009.01.014. PMC  2671474. PMID  19246009.
• Hast, M.A.; Beese, L.S. (2008). „Struktura proteinu geranylgeranyltransferázy-I z lidského patogenu Candida albicans v komplexu s lipidovým substrátem“. J Biol Chem. 283 (46): 31933–40. doi:10,1074 / jbc.M805330200. PMC  2581548. PMID  18713740.
• Warren, JJ; Pohlhaus, TJ; Changela, A; Iyer, RR; Modrich, PL; Beese, LS (2007). "Struktura komplexu rozpoznávání lézí lidské MutSalpha DNA". Mol Cell. 26 (4): 579–92. doi:10.1016 / j.molcel.2007.04.018. PMID  17531815.
• Warren, J. J.; Forsberg, L.J .; Beese, L.S. (2006). „Strukturální základ mutagenity lézí O6-methyl-guaninu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (52): 19701–6. Bibcode:2006PNAS..10319701W. doi:10.1073 / pnas.0609580103. PMC  1750904. PMID  17179038.
• Terry, K.L .; Casey, P.J .; Beese, L.S. (2006). "Konverze proteinové farnesyltransferázy na geranylgeranyltransferázu". Biochemie. 45 (32): 9746–55. doi:10.1021 / bi060295e. PMID  16893176.
• Lane, K.T .; Beese, L.S. (2006). "Tematický přehled: posttranslační modifikace lipidů. Strukturní biologie proteinu farnesyltransferázy a geranylgeranyltransferázy typu I." Journal of Lipid Research. 47 (4): 681–699. doi:10.1194 / jlr.r600002-jlr200. PMID  16477080.
• Beese, L. a Harvardská univerzita. (2005). Struktura a mechanismus proteinových prenyltransferáz: Analýza terapeutického cíle rakoviny.
• Beese, L. a Harvardská univerzita. (2005). Struktury a mechanismy DNA polymerázy: Nature's copier and spellchecker in action.
• Johnson, S.J .; Beese, L.S. (2004). "Struktury chyb neshody replikace pozorované v DNA polymeráze". Buňka. 116 (6): 803–816. doi:10.1016 / s0092-8674 (04) 00252-1. PMID  15035983.
• Hsu, G.W .; Ober, M .; Carell, T .; Beese, L.S. (2004). „Chybně náchylná replikace oxidačně poškozené DNA vysoce přesnou DNA polymerázou“. Příroda. 431 (7005): 217–21. Bibcode:2004 Natur.431..217H. doi:10.1038 / nature02908. PMID  15322558.
• Johnson, S.J .; Taylor, J.S .; Beese, L.S. (2003). „Procesní syntéza DNA pozorovaná v polymerázovém krystalu naznačuje mechanismus prevence mutací posunu snímků“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (7): 3895–3900. Bibcode:2003PNAS..100.3895J. doi:10.1073 / pnas.0630532100. PMC  153019. PMID  12649320.
• Taylor, J.S .; Reid, T.S .; Terry, K.L .; Casey, P.J .; Beese, L.S. (2003). "Struktura savčího proteinu geranylgeranyltransferáza typu 1". EMBO J.. 22 (22): 5963–5974. doi:10.1093 / emboj / cdg571. PMC  275430. PMID  14609943.
• Long, SB; Casey, P .; Beese, LS (2002). "Reakční cesta proteinové farnesyltransferázy při atomovém rozlišení". Příroda. 419 (6907): 645–50. Bibcode:2002 Natur.419..645L. doi:10.1038 / nature00986. PMID  12374986.
• Long, SB; Hancock, PJ; Kral, AM; Hellinga, HW; Beese, LS (2001). „Krystalová struktura lidského proteinu farnesyltransferázy odhaluje základ pro inhibici tetrapeptidy CaaX a jejich mimetiky“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (23): 12948–53. Bibcode:2001PNAS ... 9812948L. doi:10.1073 / pnas.241407898. PMC  60805. PMID  11687658.
• Kiefer, J. R .; Mao, C .; Braman, J. C .; Beese, L. S. (1998). „Vizualizace replikace DNA v katalyticky aktivním krystalu DNA polymerázy Bacillus [viz komentáře]“. Příroda. 391 (6664): 304–7. doi:10.1038/34693. PMID  9440698.

Reference