Lig RNA teploměr - Lig RNA thermometer

Lig RNA teploměr
RF02815.svg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence Lig teploměru
Identifikátory
RfamRF02815
Další údaje
DoményBakterie
JÍTGO termín musí začínat GO:,GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 005836,SO: 0000204
PDB strukturPDBe

Lig RNA teploměr je cispůsobící nekódující RNA prvek, který řídí ligA a ligB genová exprese v Leptospira interrogans v reakci na změnu teploty.[1] The lipoproteiny LigA a LigB stimulují adhezi prvku a poté hostují proteiny.[2] RNA, která se skládá ze 175 nukleotidů 5'UTR a prvních šest lig kodony (identické v ligA a ligB) se skládá do dvou odlišných kmenových struktur smyčky. Lig výraz je těmito omezen dvouřetězcová RNA struktury, protože uzavírají ribozom -závazné místo. Při vyšších teplotách je vazebné místo ribozomu vystaveno, aby se podpořila iniciace translace.[1]

Reference

  1. ^ A b Matsunaga J, Schlax PJ, Haake DA (listopad 2013). „Role pro cis působící RNA sekvence v teplotně závislé expresi multiadhezivních lig proteinů v Leptospira interrogans“. Journal of Bacteriology. 195 (22): 5092–5101. doi:10.1128 / JB.00663-13. PMC  3811586. PMID  24013626.
  2. ^ Choy HA, Kelley MM, Chen TL, Møller AK, Matsunaga J, Haake DA (květen 2007). „Fyziologická osmotická indukce adheze Leptospira interrogans: LigA a LigB váží proteiny extracelulární matrix a fibrinogen“. Infekce a imunita. 75 (5): 2441–2450. doi:10.1128 / IAI.01635-06. PMC  1865782. PMID  17296754.