KiSAO - KiSAO
 | |
|---|---|
| Obsah | |
| Popis | Ontologie poskytující podporu při jednoznačném odkazování na simulační algoritmy při popisu simulačního experimentu. |
| Typy dat zajat | simulační algoritmy, jejich charakteristiky a parametry |
| Kontakt | |
| Výzkumné centrum | EMBL-EBI |
| Primární citace | PMID 22027554 |
| Přístup | |
| Standardy | MIRIAM |
| Datový formát | SOVA |
| webová stránka | Domovská stránka KiSAO, KiSAO na BioPortalu |
| Stáhnout URL | Domovská stránka KiSAO |
| Nástroje | |
| Samostatný | libKiSAO, java knihovna pro dotazování KiSAO |
| Smíšený | |
| Licence | Umělecká licence |
| Verze | 2.3.5 (duben 2014) |
| Kurátorská politika | ano (manuální) |
| Bookmarkable subjekty | Ano |
The Ontologie kinetického simulačního algoritmu (KiSAO) poskytuje informace o existujících algoritmech dostupných pro simulaci biologie systémů modely, jejich charakterizace a vzájemné vztahy. KiSAO je součástí BioModels.net projektu a KOMBAJN iniciativa.[1]
Struktura
KiSAO se skládá ze tří hlavních větví:
- simulační algoritmus
- charakteristika simulačního algoritmu
- parametr simulačního algoritmu
Prvky každé větve algoritmu jsou propojeny s charakteristickými větvemi a větvemi parametrů pomocí má charakteristiku a má parametr odpovídajícím způsobem. Samotná větev algoritmu je hierarchicky strukturována pomocí vztahů, které naznačují, že potomkovy algoritmy byly odvozeny od obecnějších předků nebo je specifikují.
Viz také
Reference
- ^ Courtot, M .; Juty, N .; Knupfer, C .; Waltemath, D .; Zhukova, A .; Drager, A .; Dumontier, M .; Finney, A .; Golebiewski, M .; Hastings, J .; Hoops, S .; Keating, S .; Kell, D. B .; Kerrien, S .; Lawson, J .; Lister, A .; Lu, J .; Machne, R .; Mendes, P .; Pocock, M .; Rodriguez, N .; Villeger, A .; Wilkinson, D. J .; Wimalaratne, S .; Laibe, C .; Hucka, M .; Le Novere, N. (2014). „Řízené slovníky a sémantika v systémové biologii“. Molekulární systémy biologie. 7: 543. doi:10.1038 / msb.2011.77. PMC 3261705. PMID 22027554.