Joshua Vogelstein - Joshua Vogelstein

Joshua T. Vogelstein
narozený
Joshua T. Vogelstein

1980 (věk 39–40)
Spojené státy
Alma materWashington University, St. Louis
Univerzita Johna Hopkinse
Známý jakoConnectomics, Teorie grafů
Manžel (y)Kathryn Vogelstein
Děti2
OceněníDoporučeno F1000 Prime (2014),[1]

Spotlight, Neural Information Processing Systems (2013),

Spotlight, Computational and Systems Neuroscience (2008)
Vědecká kariéra
InstituceUniverzita Johna Hopkinse
Biomedicínské inženýrství
TezeOOPSI: Rodina optimálních algoritmů pro odvození optických špiček pro odvození neurální konektivity z populačního zobrazování vápníku  (2009)
Doktorský poradceEric Young
Ostatní akademičtí poradciCarey Priebe
webová stránkaneurodata.io

Joshua T. Vogelstein je americký biomedicínský inženýr. Je odborným asistentem Biomedicínské inženýrství na Univerzita Johna Hopkinse, kde sedí v Centru pro zobrazovací vědu. Vogelstein také pořádá společná jmenování do oddělení JHU pro aplikovanou matematiku a statistiku, informatiku a neurovědu. Má jmenování v Institutu pro intenzivní inženýrství a vědy o datech a Vogelstein je ředitelem oblasti zaměřené na oblast biomedicínských dat pro program biomedicínského inženýrství Johnse Hopkinse.[2] Joshua Vogelstein je také členem řídícího výboru a přidruženým členem Kavli Neuroscience Discovery Institute a také hostujícím vědeckým pracovníkem Howarda Hughese Medical Institute.

Výzkum společnosti Vogelstein se zaměřuje na pochopení toho, jak se nejlépe analyzují masivní biomedicínské datové soubory, aby se objevily nové poznatky o funkci živých systémů ve zdraví a nemocech a jak lze tyto znalosti využít k poskytování vylepšené a dostupnější zdravotní péče. Jednou ze současných oblastí studia Vogelsteina je spojkové kódování, rozvíjející se obor zaměřený na studium toho, jak struktura mozku spíše než mozková aktivita kóduje informace; to představuje posun od tradičního studia neurální kódování. Jeho práce se zaměřuje převážně na velká a široká data v neurovědě, se zaměřením na statistiky mozkových grafů a konektomika.

Joshua Vogelstein také spoluzaložil Gigantum, platformu pro vytváření a spolupráci na open-source datech.[3]

Vzdělávání

Vogelstein absolvoval vysokoškolské studium na Washingtonská univerzita v St. Louis kde obdržel své Bakalář věd vystudoval biomedicínské inženýrství v roce 2002. V letech 2003 až 2009 studoval na Univerzita Johna Hopkinse, kde obdržel své Mistr vědy v oboru Aplikovaná matematika a statistika a PhD v oboru Neurovědy na Lékařské fakultě Johna Hopkinse, kde vyvinul algoritmy pro detekci špiček v zobrazování vápníku.

Kariéra a výzkum

Joshua Vogelstein řídí NeuroData společně s Randalem Burnsem, který vytvořil ekosystém open-source nástrojů pro neurovědy a hostí kolekci open-source dat.[4]

Joshua Vogelstein byl v poradním výboru mnoha komerčních společností, včetně Gigantum, Mind-X a PivotalPath. Byl také spoluzakladatelem poradenské firmy pro datové vědy d8alab. V letech 2014--2018 byl Vogelstein ředitelem vysokoškolského studia na Ústavu výpočetní medicíny. Pracoval také jako vědecký pracovník Endeavour v Institutu dětské mysli], vedoucí vědecký pracovník pro oddělení statistických věd a matematiky a neurobiologie na univerzitě Johns Hopkins University a jako přidružená fakulta na Duke University.

Vogelstein také zastával pozici vedoucího datového vědce ve společnosti Global Domain Partners, LLC.[5]

Reference

  1. ^ „NeuroData Awards“.
  2. ^ Joshua, Vogelstein. "vogelstein cv" (PDF). github.
  3. ^ "Gigantum".
  4. ^ Vogelstein, Joshua T .; Perlman, Eric; Falk, Benjamin; Baden, Alex; Gray Roncal, William; Chandrashekhar, Vikram; Collman, Forrest; Seshamani, Sharmishtaa; Patsolic, Jesse L .; Lillaney, Kunal; Kazhdan, Michael; Hider, Robert; Pryor, Derek; Matelsky, Jordan; Gion, Timothy; Manavalan, Priya; Wester, Brock; Chevillet, Mark; Trautman, Eric T .; Khairy, Khaled; Bridgeford, Eric; Kleissas, Dean M .; Tward, Daniel J .; Crow, Ailey K .; Hsueh, Brian; Wright, Matthew A .; Miller, Michael I .; Smith, Stephen J .; Vogelstein, R. Jacob; et al. (2019). „Komunitně vyvinutý open-source výpočetní ekosystém pro velká neuro data“. Přírodní metody. 15 (11): 846–847. arXiv:1804.02835. doi:10.1038 / s41592-018-0181-1. PMC  6481161. PMID  30377345.
  5. ^ „globální doménoví partneři“.

externí odkazy