JAligner - JAligner

JAligner je otevřený zdroj Jáva provádění Smith-Watermanův algoritmus[1] s Gotohovým vylepšením[2] pro biologickou lokální dvojici zarovnání sekvence za použití pokuta za afinní mezeru Modelka. Napsal to Ahmed Moustafa.

Viz také

Reference

  1. ^ Smith TF a Waterman MS (1981). Identifikace společných molekulárních subsekvencí. J Mol Biol, 147: 195-197.
  2. ^ Gotoh O (1982). Vylepšený algoritmus pro porovnávání biologických sekvencí. J Mol Biol, 162: 705-708.

externí odkazy