Mezinárodní informační systém o rostlině - International Crop Information System

The Mezinárodní informační systém o rostlině (ICIS) byl otevřený zdroj databázový systém vedené výzkumníky z Mezinárodní institut pro výzkum rýže (IRRI)[1] který poskytoval integrované řízení globálních informací o zlepšování a řízení plodin jak pro jednotlivé plodiny, tak pro zemědělské systémy. Projekt byl motivován nejednoznačným zárodečná plazma identifikace, obtíže se sledováním informací o původu a nedostatečná integrace mezi genetickými zdroji, šlechtění, hodnocení, využití a údaje o řízení, což vše vedlo k omezení úsilí o intenzivnější výzkum plodin. Ve spolupráci s IRRI vyvinuli ICIS zemědělští vědci a informační technici v několika centrech poradní skupiny pro Mezinárodní zemědělský výzkum (CGIAR), v pokročilých výzkumných institucích (ARI) a v národních zemědělských výzkumných systémech (NARS), aby tyto překážky řešily.

Projekt byl ukončen v roce 2011.[1]

Implementace

Implementace ICIS v oblasti rýže byla označována jako „Mezinárodní informační systém o rýži“ nebo „IRIS“.[2] Existovaly další implementace pro jiné plodiny, včetně implementace pšenice známé jako „IWIS“, jedné pro čočku známou jako „ILIS“, cizrny „IChIS“, fazole „IFIS“ a dalších.[3][4]

Reference

  1. ^ A b Yates, Shawn; Lagüe, Martin (26. října 2018). „Crop Information Engine and Research Assistant (CIERA) pro správu genealogických, fenotypových a genotypových dat pro šlechtitelské programy“ (PDF). doi:10.1101/439505. S2CID  91666439. Citováno 3. srpna 2020. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  2. ^ ABC, Robert (2010). „LEXSYS: Architecture and Implication for Intelligent Agent systems“ (PDF). arXiv:1003.5173. Citováno 3. srpna 2020.
  3. ^ Yadav, Shyam Singh; McNeil, David L .; Redden, Robert; Patil, Sharanagouda A. (06.06.2010). Změna podnebí a řízení plodin luštěnin v chladném období. Springer Science & Business Media. ISBN  978-90-481-3709-1.
  4. ^ anchoret-wright (2014-11-18). „Mezinárodní informační systém o rostlině: jeho vývoj a implementace rýže a pšenice“. SlideServe. Citováno 2020-08-04.

Specifické odkazy ICIS

  • Bruskiewich R, Cosico A, Eusebio W, Portugalsko A, Ramos LR, Reyes T, Sallan MAB, Ulat VJM, Wang X, McNally KL, Sackville Hamilton R a McLaren CG. „Propojení genotypu s fenotypem: Mezinárodní informační systém o rýži (IRIS).“ 2003. Bioinformatika 19 (Suppl.1): i63-i65
  • Fox, PN. a Skovmand, B. (1996). „The International Crop Information System (ICIS) - connects genebank to breeder to farmers 'field.“ Adaptace rostlin a zdokonalování plodin (ed. M. Cooper a G.L. Hammer), CAB International. 317–326.
  • McLaren, CG; Bruskiewich, RM; Portugalsko, AM; Cosico, AB. 2005. "Mezinárodní rýžový informační systém. Platforma pro metaanalýza údajů o plodinách rýže. “ Plant Physio. 139 (2): 637-642
  • Portugalsko, Arllet; Balachandra, Ranjan; Metz, Thomas; Bruskiewich, Richard a McLaren, Graham; „Mezinárodní plodina Informační systém pro Germplasm Správa dat." 2007, Rostlinná bioinformatika: Metody a protokoly. Dave Edwards, redaktor. Methods Mol Biol.406: 459-72 Humana Press. Totowa, New Jersey, USA

Související odkazy na projekty

  • Bruskiewich, Richard et al 2008 "Platforma Generation Challenge Program: Sémantické standardy a Workbench pro Crop Science ", International Journal of Plant Genomics, sv. 2008, ID článku 369601, 6 stran. doi:10.1155/2008/369601
  • Bruskiewich, Richard et al 2006. Program generačních výzev (GCP) - standardy pro údaje o plodinách. OMICS 10 (2): 215-219
  • Bruskiewich R, Metz T a McLaren G. 2006. Bioinformatika a plodina informační systémy ve výzkumu rýže. IRRN 31 (1): 5-12

externí odkazy