Hepatitida C, alternativní čtecí rámec, kmenová smyčka - Hepatitis C alternative reading frame stem-loop

Hepatitida C, alternativní čtecí rámec, kmenový kruh
RF00620.jpg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence z HCV_ARF_SL
Identifikátory
SymbolHCV_ARF_SL
RfamRF00620
Další údaje
RNA typCis-reg
DoményViry
TAKSO: 0000233
PDB strukturPDBe

Hepatitida C, alternativní čtecí rámec, kmenová smyčka je konzervovaný sekundární struktura motiv identifikovaný v RNA genom Virus hepatitidy C. (HCV), u kterého se předpokládá, že hraje důležitou roli při regulaci překlad a represi virového genomu.

Oblast kódující jádrový protein genomu viru hepatitidy C (HCV) obsahuje alternativu +1 čtecí rámec (ARF) a dva navržené fylogeneticky konzervované formování šroubovice RNA stonková smyčka struktury (IV a VII ).[1]Proteiny přeložené z ARF se zdají být přeloženy během normálního životního cyklu viru, ale nejsou nezbytné pro replikaci viru.[1] Navrhované dvě předpovězené kmenové smyčky (SLV a SLVI) jsou důležité pro translaci a represi HCV; tyto kmenové smyčky jsou umístěny po proudu od Místo vstupu do vnitřního ribozomu (IRES), ale jejich funkční role není známa.[1]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C McMullan LK, Grakoui A, Evans MJ, Mihalik K, Puig M, pobočka AD, Feinstone SM, Rice CM (2007). „Důkaz funkčního prvku RNA v kregenu viru hepatitidy C“. Proc Natl Acad Sci USA. 104 (8): 2879–2884. Bibcode:2007PNAS..104,2879 mil. doi:10.1073 / pnas.0611267104. PMC  1815275. PMID  17299041.

externí odkazy