GigaDB - GigaDB

GigaDB
Logo GigaDB.png
Typ webu
Disciplinární úložiště
K dispozici vAngličtina
MajitelGigaScience /China National GeneBank
URLgigadb.org
Spuštěno2011
Aktuální stavAktivní
Licence na obsah
CC0

GigaDB (GigaScience DataBase) je disciplinární úložiště zahájena v roce 2011[1] s cílem zajistit dlouhodobý přístup k masivním multidimenzionálním souborům dat ze studií biologie a biomedicíny. Datové sady jsou různorodé a zahrnují genomický, transkriptomické a obrazové údaje. Datové sady jsou sestavovány biokurátory GigaDB, které jsou zaměstnány BGI a China National GeneBank.

Od svého vzniku byla GigaDB navržena jako podpůrný archiv pro rozsáhlá výzkumná data předkládaná do datový deník GigaScience jehož cílem je zajistit reprodukovatelnost a znovu použitelnost biologického a biomedicínského výzkumu. Rozsah GigaDB se rozšířil o výpočetní výzkumné objekty, jako jsou syntetická data, software a pracovní toky.[2] Datové sady hostované v GigaDB jsou definovány jako skupina souborů a metadat, která podporují konkrétní článek nebo studii. Pro každou publikovanou datovou sadu GigaDB, a DataCite identifikátor digitálních objektů je přiřazen a data jsou indexována a zjistitelná v NCBI Datamed a Clarivate Analytics Index datové citace. GigaDB také spolupracoval s Pozitivní posílit zjistitelnost jejich lidských datových sad.[3]

Reference

  1. ^ Edmunds, Scott C .; Li, Peter; Sneddon, Tam P. (2012-12-01). „GigaDB: ohlašování databáze GigaScience“. GigaScience. 1 (1): 11. doi:10.1186 / 2047-217X-1-11. PMC  3626507. PMID  23587345.
  2. ^ Hunter, Christopher Ian; Tuli, Mary Ann; Li, Peter; Goodman, Laurie; Edmunds, Scott; Armit, Chris; Xiao, Si Zhe (01.01.2019). „Zvýšená interaktivita a vylepšení databáze GigaScience, GigaDB“. Databáze. 2019: baz016. doi:10.1093 / databáze / baz016. PMC  6376146. PMID  30753480.
  3. ^ „Pozitivní vývoj platformy pro spolupráci prémiových genových dat pro výzkumníky drog“. biopharma-reporter.com. Citováno 2019-07-01.

externí odkazy