GeneSweep - GeneSweep

GeneSweep: Gene Sweepstake
datum10. května 2000 - 30. května 2003 (2000-05-10 – 2003-05-30)
Doba trvání3 roky a 20 dní
MístoCold Spring Harbor Laboratory
Projekt databáze genomu Ensembl
UmístěníGlobální
TypSázka
Vědecká sázka
TémaGenetika
Genomika
MotivOdhad celkového počtu genů v lidský genom
PořadatelEwan Birney
David Stewart
Účastníci460 sázek[1]
OceněníCena 1200 $
webová stránkawww.sembl.org/ genesweep.html[2]

GeneSweep nebo Gene Sweepstake byl loterie a vědecká sázka aby vědci vsadili na celkový počet geny v lidský genom.[3][4][5][6][7][8] Soutěž byla zahájena v a Cold Spring Harbor Laboratory konference v roce 2000.[2][9][10][11][12] Zpočátku bylo možné uzavírat sázky za 1 $, který byl v roce 2001 zvýšen na 5 $ a v roce 2002 na 20 $.[2] Náklady na uzavření sázky se významně zvýšily, protože se od pozdějších účastníků očekávalo, že budou mít k dispozici mnohem přesnější informace, aby mohli informovat své odhady.[13] Do 23. května 2000 bylo podáno 228 sázek, přičemž průměrný počet předpovězených genů byl 62 598.[14]

Výherní sázky v roce 2003

30. května 2003 Ewan Birney z Evropský bioinformatický institut, který organizoval bazén,[2] vyhlásil vítěze: Lee Rowen z Ústav pro systémovou biologii.[15] Rowen hádal, že lidský genom bude obsahovat 25 947 genů, což je nejblíže odhadovanému počtu 24 847 daných Projekt databáze genomu Ensembl. Kromě vítězného odhadu to byla také nejnižší z více než 460 sázek, které byly podány.[1] Rowen rozdělil prize pool o 1 200 $ na Paul Dear of the Rada pro lékařský výzkum (MRC) a Olivier Jaillon z Genoskop. Rowen připsán Jean Weissenbach Genoskopu a přesvědčit ji, že skutečný počet lidských genů bude relativně nízký. Všichni tři vítězové se o cenu podělili, protože byli jedinými sázejícími, kteří tipovali méně než 30 000, a Birney si byla jistá, že celkový počet genů je nižší.[16] The loterie vždy se plánovalo skončit v roce 2003, protože Birney očekávala, že Ensembl do té doby dokončí počítání počtu lidských genů. Jakmile bylo jasné, že k dosažení přesného počtu budou potřebovat více času, Birney původně plánovala prodloužení loterie o dalších pět let. David Stewart však Birneyho přesvědčil, aby si vybral vítěze, a poukázal na to, že pravidla určovala, že vítěze bylo třeba zvolit v roce 2003, a to bez výjimek. Birney poznamenal, že ačkoli přesný počet stále nebyl znám, nebylo pochyb o tom, že počet lidských genů byl mnohem menší než 26 000, a oznámil, že 21 000 byl nejlepší odhad v rozhovoru z roku 2003.[17]

Probíhající debata po roce 2003

Od roku 2018 mezi vědci stále probíhá debata o celkovém počtu genů v lidském genomu, přičemž většina odhadů se pohybuje od 19 000 do 22 000.[18][19]

Reference

  1. ^ A b Pearson, Helen (2003). „Genetici marně hrají hru s čísly“. Příroda. 423 (6940): 576. doi:10.1038 / 423576a. ISSN  0028-0836. PMID  12789304.
  2. ^ A b C d Birney, Ewan (2000). „Gene Sweepstake („ Genesweep “)“. ensembl.org. Archivovány od originál dne 2000-08-16.
  3. ^ Anon (2002). „Špičkoví výzkumníci genomu se scházejí v Cold Spring Harbor“. cshl.edu. Cold Spring Harbor Laboratory.
  4. ^ Zhang, Jianzhi (2007). "Unášený lidský genom". Sborník Národní akademie věd. 104 (51): 20147–20148. doi:10.1073 / pnas.0710524104. ISSN  0027-8424.
  5. ^ Choi, Charles Q (2003). „Kdo zametne sázku na gen?“. Genome Biology. 4. doi:10.1186 / gb-reflektor-20030430-01. ISSN  1465-6906.
  6. ^ Leach, Martin (2004). "Informatika o genovém výrazu". 258: 153–166. doi:10.1385/1-59259-751-3:153. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  7. ^ Giles, Jim (2002). „Chceš se vsadit?“. Příroda. 420 (6914): 354–355. doi:10.1038 / 420354a. ISSN  0028-0836.
  8. ^ Pennisi, Elizabeth (2003). „Bioinformatika: Génové boje bojují o správnou odpověď“. Věda. 301 (5636): 1040–1041. doi:10.1126 / science.301.5636.1040. ISSN  0036-8075.
  9. ^ Semple, Colin (2000). "Genová předpověď: konec začátku". Genome Biology. 1 (2). doi:10.1186 / gb-2000-1-2-reports4012.
  10. ^ Harris, Richard F. (2000). "Genofond". Aktuální biologie. 10 (14): R506. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00590-X. ISSN  0960-9822.
  11. ^ Anon (2000). „Povaha čísla“. Genetika přírody. 25 (2): 127–128. doi:10.1038/75946. ISSN  1061-4036.
  12. ^ Smaglik, Paul (2000). „Vědci riskují hazard s lidským genomem“. Příroda. 405 (6784): 264–264. doi:10.1038/35012771. ISSN  0028-0836.
  13. ^ Anon (2000). „Hazardní hry na genomu“. Journal of the National Cancer Institute. 92 (17): 1373. doi:10.1093 / jnci / 92.17.1373. PMID  10974068.
  14. ^ Wade, Nicholas (2000). „Vědci sázejí na lidské geny; vítěz bude vybrán v roce 2003“. nytimes.com. The New York Times. ISSN  0362-4331. Citováno 2019-10-21.
  15. ^ Pearson, Helen (2003). "Sázka na číslo lidského genu vyhrála". Příroda. doi:10.1038 / novinky030602-3. ISSN  0028-0836.
  16. ^ Pennisi, Elizabeth (2003). „Nízké počty vyhrávají fond GeneSweep“. sciencemag.org. Věda. Citováno 2019-10-21.
  17. ^ Wade, Nicholas (2003). „Gene loterie končí, ale vítěz se může mýlit“. nytimes.com. The New York Times. ISSN  0362-4331. Citováno 2019-10-21.
  18. ^ Willyard, Cassandra (2018). „Nová diskuse o lidském genu znovu rozpoutá debatu“. Příroda. 558 (7710): 354–355. doi:10.1038 / d41586-018-05462-w. ISSN  0028-0836. PMID  29921859.
  19. ^ Pertea, Mihaela; Salzberg, Steven L. (2010). „Mezi kuřetem a hroznem: odhad počtu lidských genů“. Genome Biology. 11 (5): 206. doi:10.1186 / gb-2010-11-5-206. ISSN  1465-6906. PMC  2898077. PMID  20441615.