S předčasnou smrtí svého staršího bratra Fujiwara no Torikai se Nagate stal účinným vůdcem Hokke. V roce 737 byl povýšen z ju roku-i no ge (従 六位 下) na ju roku-i no jō (従 六位 上), ale tehdejší císař, Shōmu, upřednostňoval Nagateova mladšího bratra Yatsuka. Nagate byl znovu povýšen až v roce 749, těsně před císařovou abdikací, kdy získal hodnost ju shi-i no ge (従 四位 下).
Na dvoře nového vládce byl více ceněn Císařovna Kóken, kde byl povýšen na ju shi-i no jō (従 四位 上) v 750 a znovu v 754 až ju san-mi (従 三位), označující ho mezi řadami kugyo. Bezprostředně po smrti bývalého císaře Shomu v roce 756 byl Nagate povýšen přímo na chūnagon, přeskakování sangi zcela.
Na druhou stranu zůstal ve střetu se svým mocným příbuzným Fujiwara no Nakamaro. Po vydědění korunního prince Funada v roce 757 nastoupil do Fujiwara no Toyonari v podpoře prince Shioyakiho jako nového dědice císařovny Kóken, ale Nakamarův oblíbený kandidát princ Ōi, budoucnost Císař Junnin, vyhrál. V roce 758 byl Nagate jediným členem výboru, který seděl daijō-kan schůzku svolal Nakamaro. Po roce 757 Nakamaro ovládal soud a tento špatný vztah zanechal Nagate v nepohodlné politické pozici, navzdory jeho postavení třetího nejmocnějšího muže v Daijō-kan po Ishikawa žádný Toshitari a Fun'ya ne Kiyomi.
V roce 764 se Fujiwara žádný Nakamaro bouřil a Nagate podporoval stranu císařovny Kōken a Dókyo. Byl povýšen na shō san-mi (正 三位) a Dainagon a udělené vyznamenání, druhé třídy. Poté, co Dōkyō založil svou moc a po Toyonariho smrti v roce 765, Nagate zastával pozici nejmocnějšího kugyo v daijō-kan až do své smrti. V roce 766 byl povýšen na udaijin a pak sadaijin a získal hodnost shō ni-i (正 二 位).
Císařovna Kōken zemřela v roce 770 a v následném sporu o dědice Nagate podporoval prince Shirakabe, budoucnost Císař Kōnin. Za své úsilí byl odměněn povýšením na šo ichi-i (正 一位) novým panovníkem.
Nagate zemřel na nemoc 11. března 771 ve věku 58 let. Posmrtně mu bylo uděleno postavení Daijo-daijin ten samý den.
^ AbCdEKanai, Madoka; Nitta, Hideharu; Yamagiwa, Joseph Koshimi (1966). Aktuální historie Japonska. Pokyny podvýboru pro jazyk Dálného východu Výboru pro institucionální spolupráci. str. 6.
^ AbBrown, Delmer M. (1988). Cambridge History of Japan: Volume 1. Cambridge University Press. ISBN9780521223522.