Flavivirová kapsidová vlásenka cHP - Flavivirus capsid hairpin cHP
Flavivirová kapsidová vlásenka cHP | |
---|---|
![]() Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence cHP | |
Identifikátory | |
Symbol | cHP |
Rfam | RF00617 |
Další údaje | |
RNA typ | Cis-reg |
Domény | Viry |
TAK | SO: 0000233 |
PDB struktur | PDBe |
The Flavivirová kapsidová vlásenka cHP je konzervovaný RNA sponka do vlasů struktura identifikovány v rámci kapsid kódovací oblast několika flavivirus genomy. Tyto pozitivní prvky RNA genomy jsou přeloženo jako jediný polypeptid a následně štěpen na základní proteiny, z nichž první je kapsidový protein. Vlásenka cHP je umístěna v oblasti kódující kapsidu mezi dvěma AUG spustit kodony. Ukázalo se, že cHP cis prvek řídí přímý start translace ze suboptimálního prvního startovacího kodonu.[1] Schopnost cHP řídit přímou iniciaci z prvního startovacího kodonu je úměrná jeho termodynamické stabilitě, je závislá na poloze a je nezávislá na sekvenci. Bylo prokázáno, že jak AUG, tak konzervovaný cHP jsou nezbytné pro účinnou virovou replikaci v lidských a komářích buňkách.[1]
Reference
- ^ A b Clyde K, Harris E (2006). „Sekundární struktura RNA v oblasti kódování viru dengue typu 2 přímý překlad zahajuje výběr kodonu a je vyžadována pro virovou replikaci“. J Virol. 80 (5): 2170–2182. doi:10.1128 / JVI.80.5.2170-2182.2006. PMC 1395379. PMID 16474125.
externí odkazy
![]() | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |