FastContact - FastContact
 | Tento článek má několik problémů. Prosím pomozte vylepši to nebo diskutovat o těchto otázkách na internetu diskusní stránka. (Zjistěte, jak a kdy tyto zprávy ze šablony odebrat) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)
|
FastContact je algoritmus pro rychlý odhad kontaktu a vazby volné energie pro strukturní struktury protein-protein. Vychází ze statisticky stanoveného desolvation kontaktní potenciál a Coulomb elektrostatika závislé na vzdálenosti dielektrická konstanta. Aplikace také hlásí zbytkové bezdotykové energie, které rychle zvýrazňují aktivní body interakce.
Program byl napsán v Fortran 77 Carlos J. Camacho a Chao Zhang na katedře výpočetní biologie, University of Pittsburgh, PA.[1] Webový server pro online provozování FastContact nebo stahování binárních souborů zřídil P. Christoph Champ v červenci 2005.[2][3]
Reference
- ^ Camacho CJ, Zhang C (2005). „FastContact: rychlý odhad kontaktních a vazebných volných energií“. Bioinformatika. 21 (10): 2534–2536. doi:10.1093 / bioinformatika / bti322. PMID 15713734.
- ^ Camacho CJ, Ma H, Champ PC (2006). „Bodování rozmanité sady vysoce kvalitních ukotvených konformací: metascore založené na elektrostatických a desolvatačních interakcích“. Proteiny. 63 (4): 868–877. doi:10,1002 / prot.20932. PMID 16506242.
- ^ Champ PC, Camacho CJ (2007). „FastContact: bezplatný nástroj pro hodnocení energie pro struktury komplexu protein-protein“. Nucleic Acids Res. 35 (Doplněk webu): W556–60. doi:10.1093 / nar / gkm326. PMC 1933237. PMID 17537824.
externí odkazy
- Binární soubory FastContact - binární soubory jsou volně dostupné ke stažení (s dokumentací).
- Server FastContact - zřízený P. Christophem Champem v červenci 2005.
- FastContact Wiki
  | Tento článek týkající se bioinformatiky je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |