Databáze pozemských lidských STR alel - Earth Human STR Allele Frequencies Database

Databáze pozemských lidských STR alel
Ehstrafd logo.png
Typ webu
Projekt populační genetiky
K dispozici vAngličtina
Hlavní sídlo
Rumunsko
VytvořilStanciu Florin
URLwww.ehstrafd.org
RegistraceVolitelný
Spuštěno1. ledna 2009
Aktuální stavNeaktivní

The Databáze pozemských lidských STR alel[2] je vědecký projekt založený na dynamickém webovém rozhraní a systému správy relačních databází. Jeho hlavním účelem je správa populačních dat STR hlášených z celého světa, poskytující vysoce specializované genetické nástroje populace a také přehled genetické struktury světové populace v globálním měřítku.

Ve spodní části přístupu EHSTRAFD zůstává trend standardizace recenzovaných časopisů v publikování populačních dat[3] a co je nejdůležitější, rozložení frekvencí alel gradientu po rozsáhlých zeměpisných oblastech.[4][5][6]

Databázové nástroje (moduly)

Globální sledování alel (AFGT) - umožňuje vyhledávání distribuce frekvencí alel na globální a regionální úrovni. STR loci jsou k dispozici v AFGT, pokud jsou hlášeny alespoň u deseti populací EHSTRAFD. Seznam lokusů AFGT je trvale aktualizován s každým vydáním EHSTRAFD.

Četnost regionálních profilů (RPF) - umožňuje vypočítat frekvenci genetického profilu na globální a regionální úrovni na základě aktuálních záznamů EHSTRAFD. RPF je k dispozici pouze pro ISSOL (Interpol Standard Set Of Loci), ESS (European Standard Set - recommended by ENFSI ) a CODIS (Combined DNA Index System) loci.

Nejpravděpodobnější zeměpisný původ (MPGO) - umožňuje vyhledávat nejpravděpodobnější geografický původ daného genetického profilu STR. Geografický původ se odhaduje podle četnosti profilů v různých populacích. MPGO je k dispozici pouze pro ISSOL (Interpol Standard Set Of Loci), ESS (European Standard Set - recommended by ENFSI ) a CODIS (Combined DNA Index System) loci.

Viz také

Reference

  1. ^ „Informace o webu Ehstrafd.org“. Alexa internet. Citováno 2014-04-01.
  2. ^ EHSTRAFD - Earth Human STR Allele Frequencies Database. c2009 [citováno dne 14. června 2009 - R1]. dostupný z http://www.ehstrafd.org Archivováno 2009-07-13 na Wayback Machine
  3. ^ Patrick Lincoln, Angel Carracedo. Zveřejnění údajů o populaci lidských polymorfismů. Forensic Sci Int. 2000; 110 (1): 3-5.
  4. ^ Yates GB. Teorie korelace gradientu. c1996 [citát 16. května 2009]. Disponibila de la http://www.autismtheory.org/GradientCorrelation.htm Archivováno 2009-06-25 na Wayback Machine
  5. ^ Serre D, Pääbo S. Důkazy pro přechody lidské genetické rozmanitosti uvnitř a mezi kontinenty. Genome Res. 2004; 14 (9): 1679-85.
  6. ^ Roewer L, Croucher PJ, Willuweit S, Lu TT, Kayser M, Lessig R, de Knijff P, Jobling MA, Tyler-Smith C, Krawczak M. Podpis nedávných historických událostí v evropské distribuci haplotypu STR Y-chromozomů. Hum Genet. 2005; 116 (4): 279-91

externí odkazy