EVA (referenční hodnota) - EVA (benchmark)

EVA byl nepřetržitě běžící měřítko projekt pro hodnocení kvality a hodnoty predikce proteinové struktury a predikce sekundární struktury metody. Metody pro předpovídání obou sekundární struktura a terciární struktura - počítaje v to homologické modelování, navlékání bílkovin, a kontaktní objednávka predikce - byly porovnány s výsledky nově řešených každý týden proteinové struktury uložené v Proteinová datová banka. Cílem projektu bylo určit přesnost predikce, která by se očekávala u neodborných uživatelů běžné, veřejně dostupné predikce webové servery; toto je podobné souvisejícímu LiveBench projektu a stojí na rozdíl od dvouletého benchmarku CASP, jehož cílem je určit maximální přesnost dosažitelnou odborníky na predikci.

Reference

  • Rost B, Eyrich VA. (2001). EVA: rozsáhlá analýza predikce sekundární struktury. Proteiny Suppl 5: 192-9. PMID  11835497
  • Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Fiser A, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2001). EVA: průběžné automatické hodnocení serverů pro predikci struktury proteinů. Bioinformatika 17(12):1242-3. PMID  11751240
  • Koh IY, Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Eswar N, Grana O, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2003). EVA: Hodnocení serverů pro predikci proteinové struktury. Nucleic Acids Res 31(13):3311-5. PMID  12824315

externí odkazy