Dryad (úložiště) - Dryad (repository)
 | |
| Vývojáři | Národní centrum evoluční syntézy, UNC-CH Centrum pro výzkum metadat, Oxfordská univerzita, Britská knihovna, Kalifornská digitální knihovna |
|---|---|
| První vydání | Leden 2008 |
| Úložiště |  |
| Napsáno | Rubín |
| Licence | Nová licence BSD |
| webová stránka | datadryad |
Vodní nymfa je mezinárodní úložiště s otevřeným přístupem údajů z výzkumu, zejména údajů, z nichž vycházejí vědecké a lékařské publikace (zejména evoluční, genetická a ekologická biologie). Dryad je kurátorované úložiště pro všeobecné účely, díky němuž jsou data zjistitelná, volně použitelná a citovatelná. Vědeckým, vzdělávacím a charitativním posláním společnosti Dryad je poskytovat infrastrukturu a podporovat opakované použití údajů vědeckého výzkumu.
Vizí společnosti Dryad je vědecký komunikační systém, v němž učené společnosti, vydavatelé, instituce výzkumu a vzdělávání, finanční instituce a další zúčastněné strany společně udržují a podporují uchování a opětovné použití údajů z výzkumu.
Cílem Dryadu je umožnit vědcům ověřit publikovaná zjištění, prozkoumat nové analytické metodiky, znovu použít data pro výzkumné otázky, které původní autori neočekávali, a provádět syntetické studie, jako jsou formální metaanalýzy. U mnoha publikací stávající úložiště dat nezachycují celý datový balíček. Ve výsledku se mnoho důležitých datových sad nezachovává a v době, kdy je hledají pozdější vyšetřovatelé, již nejsou k dispozici nebo jsou použitelné.[1]
Dryad slouží jako úložiště pro tabulky, tabulky, ploché soubory a všechny ostatní druhy publikovaných dat, pro která dosud neexistují specializovaná úložiště. V optimálním případě autoři odesílají data do Dryadu ve spojení s publikací článku, takže odkazy na data mohou být zahrnuty do publikovaného článku. Všechny datové soubory v Dryadu jsou spojeny s publikovaným článkem a jsou k dispozici pro opětovné použití za podmínek a Creative Commons Zero prominutí.
Dryad je také nezisková členská organizace registrovaná v USA, která poskytuje fórum všem zúčastněným stranám, aby stanovily priority úložiště, účastnily se plánování a sdílely znalosti a koordinovaly opatření týkající se datových zásad.
Dryad je uveden v seznamu Registr výzkumných datových úložišť re3data.org.[2]
Funkce
Dryad umožňuje autorům, deníkům, společnostem a vydavatelům usnadnit archivaci dat v době publikace, kdy jsou data snadno dostupná. Data v Dryadu dostávají trvalé, jedinečné Identifikátor digitálních objektů (DOI), který lze zahrnout do publikovaného článku, aby čtenáři měli přístup k datům. Autoři mohou archivovat data v systému Dryad a mohou si být jisti jejich uchováním, přičemž budou uspokojovat mandáty časopisů a agentur financujících výzkum k šíření jejich výzkumných výstupů.[3]
Autoři odesílají data do Dryadu buď v době, kdy je přidružený článek recenzován, nebo byl přijat ke zveřejnění. Volba závisí na tom, zda deník zahrnuje data v rámci peer revieweru. Autoři mohou také odeslat data po publikování článku.
Zadávání údajů usnadňují deníky zasílající oznámení o nových rukopisech společnosti Dryad. To autorům ušetří nutnost znovu zadávat bibliografické údaje při nahrávání datových souborů.
Kurátoři Dryadu před vložením nového obsahu do úložiště zkontrolují předložené datové soubory a provedou kontrolu kvality v popisech metadat. Metadatový přístup společnosti Dryad zdůrazňuje jednoduchost a interoperabilitu podporovanou a Dublin Core metadata profil aplikace. The Centrum pro výzkum metadat nyní v Vysoká škola výpočetní techniky a informatiky, Drexel University, dříve sloužil jako centrální kurátorské centrum společnosti Dryad, přičemž primární kurátorská činnost nyní probíhá prostřednictvím neziskové organizace v Severní Karolíně. [4]
Dryad koordinuje odesílání dat do specializovaných úložišť, kde za účelem (a) snížení zátěže uživatelů zefektivněním pracovního postupu odesílání a (b) povolení Dryadu a specializovaných úložišť k výměně identifikátorů a dalších metadat za účelem umožnění křížových odkazů na různé související datové produkty s danou publikací. První dva handshaking partneři jsou TreeBASE a GenBank, které partnerské deníky společnosti Dryad dříve identifikovaly jako požadované body depozice pro data fylogenetického stromu a sekvence DNA.
Správa věcí veřejných, historie a financování
Dryad je řízen dvanáctičlenným Představenstvo, volení jeho členy. Členy mohou být nezávislé časopisy, společnosti, vydavatelé, výzkumné a vzdělávací instituce, knihovny, finančníci nebo jiné organizace podporující misi Dryadu. Organizace koordinuje zásady sdílení dat a podporuje dlouhodobou udržitelnost úložiště.
Společnost Dryad začala účtovat poplatky za podání v září 2013. Dryad je nezisková organizace, která poskytuje dlouhodobý přístup k jejímu obsahu bez jakýchkoli nákladů výzkumným pracovníkům, pedagogům nebo studentům bez ohledu na národnost nebo institucionální příslušnost. Dryad je schopen poskytnout bezplatný přístup k údajům díky finanční podpoře členů a zadavatelů údajů. Poplatky za podání od společnosti Dryad jsou navrženy tak, aby udržovaly základní funkce obnovením základních nákladů na správu a uchování dat.
Dryad se vynořil z a Národní centrum evoluční syntézy (NESCent) workshop s názvem „Zachování, sdílení a objevování digitálních dat: výzvy pro malé vědecké komunity v digitální éře“ v květnu 2007. Počáteční financování pro Dryad poskytl Národní vědecká nadace do Národní centrum evoluční syntézy a další partneři v USA.
DryadUK byl Jisc -financovaný projekt běží z Britská knihovna a University of Oxford ve spolupráci s NESCent Digitální kurátorské centrum a Charles Beagrie Ltd. Projekt vedl k britskému zrcadlu úložiště Dryad se sídlem v Britské knihovně. Projekt také vylepšil dostupné nástroje pro publikaci a citaci dat, rozšířil disciplinární škálu zúčastněných časopisů a dále rozvinul obchodní rámec pro mezinárodní organizaci zaměřenou na dlouhodobé uchovávání dat.
V roce 2019 společnost Dryad oznámila partnerství s partnerským úložištěm dat Zenodo společně vyvíjet nová řešení zaměřená na podporu pracovních postupů výzkumných pracovníků a vydavatelů i osvědčených postupů v oblasti softwaru a kurátor dat.[5]
Dryad je členem sítě Data Observation Network for Earth (DataONE ).
Software
Dryad byl původně postaven na otevřeném zdroji DSpace software úložiště, vyvinutý společností Massachusetts Institute of Technology a Hewlett Packard. V roce 2019 společnost Dryad migrovala na open-source platformu pro publikaci dat Ruby-on-Rails nazvanou Stash.
Viz také
Reference
- ^ Vision, T.J. (2010) Open Data and the Social Contract of Scientific Publishing. BioScience 60 (5): 330-330. doi:10.1525 / bio.2010.60.5.2
- ^ „Dryad Entry in re3data.org“. www.re3data.org. Citováno 21. července 2014.
- ^ Archivace dat. Michael C. Whitlock, Mark A. McPeek, Mark D. Rausher, Loren Rieseberg a Allen J. Moore, The American Naturalist, sv. 175, č. 2 (únor 2010), s. 145-146 doi:10.1086/650340
- ^ Greenberg, J., White, H., C, Carrier, C. a Scherle, R. (2009). Osvědčený postup metadat pro úložiště vědeckých dat. Journal of Library Metadata, 9: 3, 194—212. doi:10.1080/19386380903405090
- ^ Scheld, Melissanne (2019-07-17). „Financované partnerství přináší Dryad a Zenodo blíže“. Dryad novinky a pohledy. Citováno 2019-11-08.