Douglas H. Turner - Douglas H. Turner

Douglas "Doug" H. Turner je americký chemik a profesor chemie na University of Rochester.

Douglas H. Turner
Skupinový obrázek členů skupiny Turnerů a absolventů, s Dougem ve středu, na oslavě Dougových 60. narozenin.
Skupinový obrázek členů a absolventů Turnerovy skupiny, s Dougem ve středu, na Dougově oslavě 60. narozenin.
Základní informace
webová stránkahttp://rna.chem.rochester.edu/

Časný život

Doug Turner vyrostl v Brooklyn, NY, kde tvrdí: „Jako hráč s hůlkovým míčem jsem vyvinul nejlepší zakřivený míč a šroubball na mém bloku“.

Vzdělávání

Doug se zúčastnil Harvardská vysoká škola, kde vystudoval chemii a byl pověřen jako poručík v americká armáda. Absolvoval postgraduální studium na Chemických ústavech Kolumbijské univerzity a Brookhaven National Labs, kde pracoval s Georgem Flynnem a Normanem Sutinem na vývoji metody Ramanova laserového teplotního skoku pro měření kinetiky v nanosekundovém časovém měřítku. Během tohoto období také strávil tři měsíce v Annistonu v Alabamě na důstojnickém základním kurzu armádního chemického ústavu. Když se rozhodl, že se mu věda líbí víc než válka, odmítl příležitost pokračovat jako aktivní důstojník a šel na univerzitu Kalifornie v Berkeley k postdoktorátu s Ignacio Tinoco, Jr.. Tam vynalezl fluorescenční detekovaný cirkulární dichroismus pro měření optické aktivity fluorescenční složky roztoku.

Profesní život a vědecké úspěchy

V roce 1975 se Doug připojil k fakultě chemického oddělení na University of Rochester kde je stále profesorem. Doug měl také štěstí, že byl součástí akademické rodiny Tom Čech (Nobelova cena za chemii, 1989) během dvou volných let na University of Colorado v Boulderu. Doug měl neobvykle štěstí na svou vlastní akademickou rodinu 8 postdoktorandů, 49 studentů, kteří ukončili doktorské studium, a na další spolupracovníky. Společně objevili mnoho základních principů, které určují strukturu RNA.[1]Tyto principy, občas přezdívané „Turnerova pravidla“,[2] jsou používány v mnoha Algoritmy predikce struktury RNA. To pomohlo pokročit v metodách předpovídání RNA struktura ze sekvence, stejně jako interakce RNA-RNA: např. miRNA nebo siRNA vázání cíle. Metody využívající „Turnerova pravidla“ jsou široce používány biochemiky a biology.[3][4] V jeho vlastní laboratoři byly tyto metody použity k objevení potenciálně lékařsky důležitých struktur RNA v virus chřipky[5] včetně RNA pseudoknot které mohou hrát roli při regulaci sestřihu u Influenza A Segment 7 3 'spojovací místo.

V poslední době Doug a spolupracovníci použili Jaderná magnetická rezonance a Molekulární dynamika simulace krátkých RNA otestovat porozumění sekvenční závislosti stohovacích interakcí.[6][7] Ještě zbývá objevit.

Papíry, které spoluautoroval Doug, byly citovány již více než 18 000krát. Práce byla rovněž uznána Společenstvím Sloana a Guggenheima, zvolením za člena Americké asociace pro rozvoj vědy (AAAS), výběrem Americké chemické společnosti jako lektora Gordona Hammese, nepřetržitým financováním grantu NIH od roku 1976 do roku 2019 a spoluautorství více než 250 příspěvků. S Ryszardem Kierzekem z Ústavu bioorganické chemie v Poznani se v roce 2016 podělil o cenu AAAS Polsko-USA za vědu.

Doug také sloužil vědecké komunitě tím, že často učil první ročník vysokoškolského kurzu chemie a postgraduálního kurzu biofyzikální chemie, byl členem několika studijních sekcí NIH, poradního výboru Ústavu bioorganické chemie v Poznani a redakční rady Biofyzikální deník. Spolupředsedal také Gordonské konferenci o nukleových kyselinách.

Reference

  1. ^ Turner, DH; N Sugimoto; S M Freier (1988). "Predikce struktury RNA". Roční přehled biofyziky a biofyzikální chemie. 17 (1): 167–192. doi:10.1146 / annurev.bb.17.060188.001123. ISSN  0883-9182. PMID  2456074.
  2. ^ Turner, D. H .; Mathews, D. H. (2009). „NNDB: Databáze parametrů nejbližšího souseda pro predikci stability sekundární struktury nukleové kyseliny“. Výzkum nukleových kyselin. 38 (Problém s databází): D280 – D282. doi:10.1093 / nar / gkp892. PMC  2808915. PMID  19880381.
  3. ^ Dotu, I .; Lorenz, W. A .; Van Hentenryck, P .; Clote, P. (2009). "Výpočet skládacích drah mezi sekundárními strukturami RNA". Výzkum nukleových kyselin. 38 (5): 1711–1722. doi:10.1093 / nar / gkp1054. PMC  2836545. PMID  20044352.
  4. ^ Seetin, M. G .; Mathews, D. H. (2012). "Predikce struktury RNA: Přehled metod". Bakteriální regulační RNA. Metody v molekulární biologii. 905. 99–122. doi:10.1007/978-1-61779-949-5_8. ISBN  978-1-61779-948-8. PMID  22736001.
  5. ^ Moss, W. N .; Priore, S. F .; Turner, D. H. (2011). "Identifikace potenciálně konzervované sekundární struktury RNA v chřipkových a kódujících oblastech". RNA. 17 (6): 991–1011. doi:10,1261 / rna.2619511. PMC  3096049. PMID  21536710.
  6. ^ Condon, David E .; Kennedy, Scott D .; Mort, Brendan C .; Kierzek, Ryszard; Yildirim, Ilyas; Turner, Douglas H. (06.06.2015). "Stacking in RNA: NMR of Four Tetramers Benchmark Molecular Dynamics". Journal of Chemical Theory and Computation. 11 (6): 2729–2742. doi:10.1021 / ct501025q. ISSN  1549-9618. PMC  4463549. PMID  26082675.
  7. ^ Zhao, Jianbo; Kennedy, Scott D .; Berger, Kyle D .; Turner, Douglas H. (10.03.2020). „Nuclear Magnetic Resonance of Single-Stranded RNAs and DNAs of CAAU and UCAAUC as Benchmarks for Molecular Dynamics Simulation“. Journal of Chemical Theory and Computation. 16 (3): 1968–1984. doi:10.1021 / acs.jctc.9b00912. ISSN  1549-9618. PMID  31904966.