Databáze Domine - Domine Database
 | |
|---|---|
| Obsah | |
| Popis | komplexní sbírka známých a předpokládaných interakcí mezi doménami. |
| Kontakt | |
| Výzkumné centrum | Národní ústav environmentálních zdravotnických věd, Národní institut zdraví |
| Laboratoř | Systémová biologie |
| Primární citace | Yellaboina et al. (2011)[1] |
| Datum vydání | 2010 |
| Přístup | |
| webová stránka | https://manticore.niehs.nih.gov/domine |
DOMINE je databáze známých a předvídaných proteinová doména interakce (nebo interakce doména-doména).[1] Obsahuje interakce pozorované v PDB krystalové struktury a ty předpovídané několika výpočetními přístupy. DOMINE používá Pfam Profily HMM pro proteinová doména definice. Databáze DOMINE obsahuje 26 219 interakcí mezi 5 410 domén ), který zahrnuje 6 634 známých interakcí odvozených z PDB strukturní data.
Reference
- ^ A b Yellaboina; et al. (Leden 2011). „DOMINE: komplexní soubor známých a předpokládaných interakcí mezi doménami“. Nucleic Acids Res. Anglie. 39 (Problém s databází): D730-5. doi:10.1093 / nar / gkq1229. PMC 3013741. PMID 21113022.