Digitální automatizovaný identifikační systém - Digital Automated Identification System
| Vývojáři | Mark A. O'Neill |
|---|---|
| Stabilní uvolnění | 2.1.0 / 1. února 2016 |
| Napsáno | C[Citace je zapotřebí ] |
| Operační systém | Linux |
| Plošina | IA-32 x86-64 PAŽE |
| K dispozici v | Angličtina |
| Licence | Proprietární komerční software |
| webová stránka | www |
Digitální automatizovaný identifikační systém (DAISY) je automatizovaná identifikace druhů systém optimalizovaný pro rychlý screening bezobratlých (např. hmyzu) neodborníky (např. parataxonomisté ).
Byl vyvinut Dr. Mark O'Neill v polovině 90. let. Vývoj byl podpořen finančními prostředky z EU Darwinova iniciativa v roce 1997[1] a BBSRC.[2] The Práva k duševnímu vlastnictví byly získány společností O'Neill, Tumbling Dice Ltd, v únoru 2000[3] na konci financovaného grantu Darwinův projekt. Systém prošel dalším vývojem, jehož výsledkem bylo vytvoření příkladu, který je přístupný na webu a dokáže se v reálném čase vyrovnat se skupinami (např. jestřáb můry ), které obsahují několik stovek taxony. Na středním až vyšším hardwaru PC serveru (např blade server ) identifikace je možná za sekundu pro skupinu 300 taxonů. Paralelizace kritických kódů klasifikátoru DAISY (buď na zakázku FPGA technologie nebo obecné použití GPU programovací technologie jako např CUDA ) dá řádově zvýšení výkonu. To znamená, že DAISY lze nasadit k identifikaci v reálném čase ve skupinách obsahujících tisíce taxonů (např. opravdové mouchy ).
| taxon | typ obrázku | struktura | tréninkové obrázky | druh | úspěch(%) |
|---|---|---|---|---|---|
| Belize Sphingidae | RGB | křídlo | 705 | 58 | 97 |
| Xylofanes sp. | RGB | křídlo | 543 | 30 | 99 |
| Parazitické vosy | mono | křídlo | 559 | 47 | 95 |
| UK motýli | RGB | křídlo | 818 | 57 | 98 |
| UK makro můry | RGB | křídlo | 744 | 37 | 98 |
| Housenky | RGB | hlava | 91 | 7 | 93 |
| Housenky | RGB | tělo | 508 | 10 | 99 |
| Škůdci z měkkého ovoce | RGB | tělo | 2634 | 23 | 91 |
| popis | typ obrázku | struktura | tréninkové obrázky | třídy | úspěch(%) |
|---|---|---|---|---|---|
| Plechovky od jídla | RGB | označení | 31 | 5 | 100 |
| Průmyslové objekty | RGB | neodložený objekt | 155 | 14 | 100 |
| Foraminifera testy | RGB | neodložený objekt | 198 | 8 | 95 |
| Pylová zrna | RGB | neodložený objekt | 6601 | 12 | 99 |
| Pavouci | mono | genitálie | 102 | 6 | 91 |
| Lidské tváře | mono | neomezená tvář | 400 | 41 | 99 |
DAISY byl použit v několika výzkumných projektech O'Neilla[4] a další a vystupoval v populárně-vědeckých televizních a časopisových článcích. Projekt byl také předmětem nedávného článku v Věda.[5]
V roce 2011 byla na místě instalována první instalace DAISY schopná škálování na stovky taxonů Muzeum přírodní historie v Londýně. Tento server nabízel obojí VNC a webová služba rozhraní a byl schopen odložit výpočetní operace intenzivního porovnávání vzorů na NVIDIA GPU naprogramováno pomocí CUDA. Tato instalace byla schopna poskytnout identifikaci druhům, kterým byl v prostředí více uživatelů poskytnut datový soubor 300+ taxonu za méně než sekundu.
Více nedávno, pod záštitou Innovate UK financování, byl DAISY rozsáhle upraven tak, aby vyhovoval zejména potřebám předcházejících činností v ropném a plynárenském sektoru biostratigrafie. Výsledný systém GeoDAISY představuje významný technologický pokrok. Je schopen hluboké učení, zapouzdření znalostí, založené na vzorech dolování dat a (založené na) vyhledávání obsahu a může efektivně zpracovávat tréninkové sestavy skládající se z milionů vzorů na komoditním hardwaru pomocí kombinace inteligentního ukládání dat do mezipaměti a OpenMP. Další podrobnosti o GeoDAISY a důvody pro jeho vývoj jsou k dispozici jako bílé knihy na webu Omílání kostky LinkedIn strana.
Zobrazení příkladů obrázků, které byly klasifikovány pomocí DAISY
Viz také
Reference
- ^ „Automatizace identifikace hmyzu pro inventarizaci biodiverzity v Kostarice“. Darwinova iniciativa. Defra. Citováno 15. prosince 2010.
- ^ "Daisy Overview" (PDF). Tumbling Dice Ltd. 2007. Citováno 14. prosince 2010.
- ^ "Sedmikráska". Omílání kostky. Citováno 14. prosince 2010.
- ^ Watson, Anna T.; O'Neill, Mark A.; Kitching, Ian J. (2003). „Kvalitativní studie zkoumající automatizovanou identifikaci živých makrolepidopter pomocí digitálního automatizovaného identifikačního systému (DAISY)“. Systematika a biologická rozmanitost. 1: 287–300. doi:10.1017 / S1477200003001208.
- ^ Reed, Sarah (2010). "Tlačení DAISY". Věda. 328: 1628–1629. doi:10.1126 / science.328.5986.1628. PMID 20576867.
- ^ Leafsnap
- ^ iPflanzen
- ^ PlantNet
- ^ Rostliny
- ^ Plantifikátor
- ^ NatureGate