Desulfosporosinus - Desulfosporosinus
Desulfosporosinus | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | Desulfosporosinus |
Druh | |
D. acididurany |
Desulfosporosinus je rod přísně anaerobní, bakterie snižující síran, často nalezený v půda.
The druh druhu D. orientis byl izolován v roce 1959[3] s navrhovaným názvem Desulfovibrio orientis, a později byl přidělen do rodu Desulfotomaculum.[4] Na základě 16S rRNA údaje o genové sekvenci Desulfotomaculum orientis byl překlasifikován jako Desulfosporosinus orientis v roce 1997.[1]
Druh
Druh | Typ kmene | Izolované od | Poznámky | Reference |
---|---|---|---|---|
D. acididurany | M1 (DSM 27692 ) | Kyselý sediment | středně acidofilní | [5] |
D. acidiphilus | SJ4 (DSM 22704 ) | Kyselý odvodňovací sediment | středně acidofilní | [6] |
D. auripigmenti | OREX-4 (DSM 13351 ) | Sladkovodní sediment | ([7]) [8] | |
D. burensis | BSREI1 (DSM 24089 ) | Vrt | [9] | |
D. hippei | 343 (DSM 8344 ) | Permafrostová půda | [2] | |
D. lacus | STP12 (DSM 15449 ) | Sladkovodní sediment | [10] | |
D. meridiei | S10 (DSM 13257 ) | Podzemní voda kontaminovaná benzolenem | [11] | |
D. orientis | Singapur I (DSM 765 ) | Půda | ([3][4]) [1] | |
D. youngiae | JW / YJL-B18 (DSM 17734 ) | Postavený odvodňovací sediment mokřadů / kyselých dolů | [12] |
Genomy
Pět dokončeno Desulfosporosinus genomy jsou k dispozici a další dva genomy jsou v procesu sekvenování.
Kmen | Postavení | Rok | Přístupové číslo | Reference |
---|---|---|---|---|
D. acididurany M1 | Publikovaný koncept | 2015 | LDZY00000000 | [13] |
D. acidiphilus SJ4 | Vyplněno a zveřejněno | 2012 | CP003639 | [14] |
D. meridiei S10 | Vyplněno a zveřejněno | 2012 | CP003629 | [14] |
D. orientis Singapur I | Vyplněno a zveřejněno | 2011 | CP003108 | [14] |
D. sp. OT | Vyplněno a zveřejněno | 2011 | AGAF00000000 | [15] |
D. youngiae JW / YJL-B18 | Vyplněno a zveřejněno | 2011 | CM001441 | [14] |
Reference
- ^ A b C Stackebrandt, E; C Sproer; F A Rainey; J Burghardt; O Päuker; H Hippe (1997). „Fylogenetická analýza rodu Desulfotomaculum: důkazy o nesprávné klasifikaci Desulfotomaculum guttoideum a popis Desulfotomaculum orientis tak jako Desulfosporosinus orientis gen. nov., hřeben. listopad". International Journal of Systematic Bacteriology. 47 (4): 1134–1139. doi:10.1099/00207713-47-4-1134. PMID 9336920.
- ^ A b Vatsurina, A; D Badrutdinova; P Schumann; S pružina; M Vainshtein (2008). "Desulfosporosinus hippei sp. nov., bakterie snižující mezofilní sulfát izolovaná z permafrostu ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 58 (5): 1228–1232. doi:10.1099 / ijs.0.65368-0. PMID 18450718.
- ^ A b Adams, Mary E; J. R. Postgate (1959). „Nové vibrio snižující síran“. Journal of General Microbiology. 20 (2): 252–257. doi:10.1099/00221287-20-2-252.
- ^ A b Campbell, L L; J. R. Postgate (1965). "Klasifikace spór tvořících bakterií redukujících sulfáty". Bakteriologické recenze. 29 (3): 359–363.
- ^ Sánchez-Andrea, Irene; Alfons J. M. Stams; Sabrina Hedrich; Ivan Ňancucheo; D. Barrie Johnson (2014). "Desulfosporosinus acididurans sp. listopad: bakterie redukující acidofilní sulfát izolovaná z kyselých sedimentů “. Extremophiles: Život v extrémních podmínkách. 19: 39–47. doi:10.1007 / s00792-014-0701-6.
- ^ Alazard, Didier; Manon Joseph; Fabienne Battaglia-Brunet; Jean-Luc Cayol; Bernard Ollivier (2010). "Desulfosporosinus acidiphilus sp. listopad: středně acidofilní bakterie redukující síran izolovaná z kyselých těžebních drenážních sedimentů “. Extremophiles: Život v extrémních podmínkách. 14 (3): 305–312. doi:10.1007 / s00792-010-0309-4.
- ^ Newman, Dianne K .; Erin K. Kennedy; John D. Coates; Dianne Ahmann; Debra J. Ellis; Derek R. Lovley; François M. M. Morel (1997). "Dissimilační redukce arzeničnanu a síranu v Desulfotomaculum auripigmentum sp. listopad". Archiv mikrobiologie. 168 (5): 380–388. doi:10,1007 / s002030050512.
- ^ Stackebrandt, Erko; Peter Schumann; Esther Schülerová; Hans Hippe (2003). "Reklasifikace Desulfotomaculum auripigmentum tak jako Desulfosporosinus auripigmenti oprava, hřeben. listopad". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (5): 1439–1443. doi:10.1099 / ijs.0.02526-0. PMID 13130030.
- ^ Mayeux, Bruno; Marie-Laure Fardeau; Manon Bartoli-Joseph; Laurie Casalot; Agnès Vinsot; Marc Labat (2012). "Desulfosporosinus burensis sp. listopad: sporotvorná, mezofilní, sulfát redukující bakterie izolovaná z hlubokého jílovitého prostředí “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 63: 593–598. doi:10.1099 / ijs.0.035238-0. PMID 22544786.
- ^ Ramamoorthy, S; H Sass; H Langner; P Schumann; RM Kroppenstedt; S pružina; J Overmann; R F Rosenzweig (2006). "Desulfosporosinus lacus sp. nov., bakterie redukující sírany izolovaná z nedotčených sedimentů sladkovodního jezera ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56 (12): 2729–2736. doi:10.1099 / ijs.0.63610-0. PMID 17158969.
- ^ Robertson, WJ; J P Bowman; PD Franzmann; B J Mee (2001). "Desulfosporosinus meridiei sp. nov., bakterie redukující spory tvořící sulfát izolovaná z podzemní vody kontaminované benzolenem “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (1): 133–140. doi:10.1099/00207713-51-1-133. PMID 11211250.
- ^ Lee, Yong-Jin; Christopher S Romanek; Juergen Wiegel (2009). "Desulfosporosinus youngiae sp. nov., bakterie vytvářející spory a redukující sulfáty izolovaná ze zkonstruované mokřadní oblasti, která zpracovává odtok kyselého dolu. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59 (11): 2743–2746. doi:10.1099 / ijs.0.007336-0. PMID 19625426.
- ^ Petzsch, Patrick; Poehlein, Anja; Johnson, D. Barrie; Daniel, Rolf; Schlömann, Michael; Mühling, Martin (2015). "Genomová sekvence středně kyselého sulfátu snižujícího FirmicuteDesulfosporosinus acididurans (kmen M1T)". Oznámení o genomu. 3 (4): e00881-15. doi:10.1128 / genomA.00881-15. ISSN 2169-8287. PMC 4541271. PMID 26251501.
- ^ A b C d Pester, Michael; Evelyne Brambilla; Didier Alazard; Thomas Rattei; Thomas Weinmaier; James Han; Susan Lucas; Alla Lapidus; Jan-Fang Cheng; Lynne Goodwin; Sam Pitluck; Lin Peters; Galina Ovchinnikova; Hazuki Teshima; John C Detter; Cliff S Han; Roxanne Tapia; Miriam L Land; Loren Hauser; Nikos C Kyrpides; Natalia N Ivanova; Ioanna Pagani; Marcel Huntmann; Chia-Lin Wei; Karen W Davenport; Hajnalka Daligault; Řetěz Patrick S G; Amy Chen; Konstantinos Mavromatis; Victor Markowitz; Ernest Szeto; Natalia Mikhailova; Amrita Pati; Michael Wagner; Tanja Woyke; Bernard Ollivier; Hans-Peter Klenk; Stefan Spring; Alexander Loy (2012). "Kompletní genomové sekvence Desulfosporosinus orientis DSM765T, Desulfosporosinus youngiae DSM17734T, Desulfosporosinus meridiei DSM13257T, a Desulfosporosinus acidiphilus DSM22704T". Journal of Bacteriology. 194 (22): 6300–6301. doi:10.1128 / JB.01392-12. PMC 3486391. PMID 23105050.
- ^ Abicht, Helge K .; Stefano Mancini; Olga V. Karnachuk; Marc Solioz (2011). „Genome Sequence of Desulfosporosinus sp. OT, a Acidophilic Sulfate-Reduction Bacterium from Copper Mining Waste waste in Norilsk, Northern Siberia“. Journal of Bacteriology. 193 (21): 6104–6105. doi:10.1128 / JB.06018-11. PMC 3194917. PMID 21994931.