David Fell (biochemik) - David Fell (biochemist)

David Fell
NárodnostSpojené království
Alma materUniversity of Oxford
Známý jakometabolická kontrolní analýza, základní režimy, analýza rovnováhy toku
Vědecká kariéra
Polebiologie systémů, síťová biologie, genetika
InstituceOxford Brookes University
Teze (1974)
Doktorský poradceArthur Peacocke

David A. Fell je britský biochemik a profesor systémové biologie na Oxford Brookes University.[1] Vydal více než 200 publikací,[2] včetně učebnice „Porozumění regulaci metabolismu“.[3] v roce 1996.

Brzká práce

Fell provedl výzkum na fyzikální biochemii kvasinek pyruvátkináza.[4] Získal místo na Oxford Polytechnic jako lektor.[1] Jeho rané dílo na Oxfordské polytechnice se zaměřilo na hemoglobin, kde vyvinul přesnější techniky pro monitorování saturace kyslíkem[5] a rozdělení Kyselina 2,3-bisfosfoglycerová podle Fe (III) -hemomlogbin.[6] V této době také pracoval na prvních modelových studiích týkajících se fungování vysokých a nízkýchK.m cyklické nukleotidové fosfodiesterázy o regulaci adenosin 3 ', 5'-cyklický monofosfát (cAMP)[7]


Svazek: Vydání: 3 stránky: 555-561 DOI:

Pozdější kariéra

Od začátku 80. let změnil David Fell svůj výzkum na biologie systémů a byl jedním z nejranějších biologů systémů ve Velké Británii s publikacemi z roku 1979[8] dále. Dalšími významnými biologickými systémy v té době byl Henrik Kacser na University of Edinburgh. Vzhledem k tomu, že jeho rané dílo mělo významnou matematickou a výpočetní složku, měl ideální polohu, aby zvážil kvantitativnější přístup ke studiu vlastností celulárních sítí. Na tomto pozadí se obrátil k relativně novému poli s názvem metabolická kontrolní analýza jako prostředek k pochopení principů metabolické regulace. Před vývojem metabolické kontrolní analýzy bylo porozumění metabolismu založeno na kvalitativních argumentech, které vyústily v některé nesprávné závěry (Hodnotit omezující kroky ). Velká část Fellova výzkumu pro příštích 20 let se zaměřila na rozšíření a aplikaci metabolické kontrolní analýzy na metabolismus. Tato práce vyvrcholila vydáním jeho učebnice „Porozumění regulaci metabolismu“.[9] V roce 1986 vydal se svým postgraduálním studentem Rankinem Smallem jeden z prvních modelů bilance toku, kde pomocí lineárního programování zkoumali účinnost při přeměně glukózy na tuk.[10] Byl také jedním z prvních výzkumníků, kteří používali Metoda Gillespie pro stochastickou simulaci v buněčné biologii,[11] metoda, která se nyní běžně používá v systémové biologii. Na konci 90. let se jeho výzkum začal více orientovat na stechiometrickou analýzu se zvláštním důrazem na základní režimy[12] a analýza větších sítí, jako jsou ty, které se účastní fotosyntézy[13] a modely celého měřítka genomu v různých organismech, včetně jednoho z prvních modelů měřítka Arabidopsis v měřítku genomu.[14]

Publikace

Kromě jeho učebnice, která byla citována 1464krát (září 2018), patří mezi jeho prvních deset publikací:[15] dvě publikace týkající se evolučního věku používání metabolismu analýza malého světa, definice cesty z hlediska základní režimy, tři recenze na metabolickou regulační analýzu včetně opětovného vydání klíčové práce, Control of Flux od Kacsera a Burnse, dva výzkumné práce na metabolická kontrolní analýza, jeden z prvních příspěvků o používání analýza rovnováhy toku, jeden z prvních článků popisujících model modelu Cesta MAPK v signalizaci EGF a také nejranější práce, která popisuje celý genomový model rostliny Arabidopsis.

Reference

  1. ^ A b „Profesor David Fell - profesor systémové biologie“. Oxford Brookes University.
  2. ^ „David Fell - Citace Google Scholar“. scholar.google.no. Citováno 2020-08-31.
  3. ^ Fell, David (1997). Pochopení kontroly metabolismu. Portland Press. ISBN  9781855780477. OCLC  553392040.
  4. ^ Fell, David A .; Liddle, Peter F .; Peacocke, Arthur R .; Dwek, Raymond A. (1974). "Příprava a vlastnosti pyruvátkinázy z kvasinek". Biochemical Journal. 139 (3): 665–675. doi:10.1042 / bj1390665. ISSN  0264-6021. PMC  1166331. PMID  4369339.
  5. ^ Fell, Davide. "Automatizované míchací zařízení pro stanovení disociace hemoglobinu a kyslíku". The Journal of Physiology. 2823: 3P – 4P. doi:10.1113 / jphysiol.1978.sp012483. PMID  31462.
  6. ^ El-Yassin, Di; Fell, DA; Lloyd, B B; Fisher, R B (1979). „Rozklad 2,3-bis (fosfo) -d-glycerátu pomocí Fe (III) -hemoglobinu“. Biochemical Journal. 177 (1): 373–375. doi:10.1042 / bj1770373. ISSN  0264-6021. PMC  1186379. PMID  426777.
  7. ^ Fell, David A. (1980). "Teoretické analýzy fungování cyklických nukleotidových fosfodiesteráz s vysokou a nízkou Km v regulaci koncentrace adenosin 3 ', 5'-cyklického monofosfátu ve zvířecích buňkách". Journal of Theoretical Biology. 84 (2): 361–385. doi:10.1016 / s0022-5193 (80) 80011-7. ISSN  0022-5193.
  8. ^ Fell, DA; Sauro, HM (1986). "Metabolická regulace a její analýza: další vztahy mezi pružnostmi a regulačními koeficienty". European Journal of Biochemistry. 148 (3): 555–5616. doi:10.1111 / j.1432-1033.1985.tb08876.x. ISSN  0014-2956. PMID  3996393.
  9. ^ Fell, David (1997). Pochopení kontroly metabolismu. Portland Press. ISBN  9781855780477. OCLC  553392040.
  10. ^ Fell, DA; Malý, J. R. (1986). "Syntéza tuků v tukové tkáni. Zkoumání stechiometrických omezení". Biochemical Journal. 238 (3): 781–786. doi:10.1042 / bj2380781. ISSN  0264-6021. PMC  1147204. PMID  3800960.
  11. ^ Moniz-Barreto, P .; Fell, D. A. (1996), „Simulation of Dioxygen Free Radical Reactions: Ich Importance in the Initial of Lipid Peroxidation“, Biomedicínská a fyzika života, Vieweg + Teubner Verlag, str. 137–144, doi:10.1007/978-3-322-85017-1_12, ISBN  9783322850195
  12. ^ Schuster, S .; Hilgetag, C .; Schuster, R. (1996), „Stanovení základních režimů fungování v sítích biochemické reakce v ustáleném stavu“, Biomedicínská a fyzika života, Vieweg + Teubner Verlag, str. 101–114, doi:10.1007/978-3-322-85017-1_9, ISBN  9783322850195
  13. ^ Poolman, Mark G .; Fell, David A .; Raines, Christine A. (2003). "Analýza základních režimů fotosyntátového metabolismu ve stromatu chloroplastů". European Journal of Biochemistry. 270 (3): 430–439. doi:10.1046 / j.1432-1033.2003.03390.x. ISSN  0014-2956.
  14. ^ Poolman, M. G .; Miguet, L .; Sweetlove, L. J .; Fell, D. A. (2009). „Metabolický model Arabidopsis a některé jeho vlastnosti v měřítku genomu“. Fyziologie rostlin. 151 (3): 1570–1581. doi:10.1104 / str. 109.141267. ISSN  0032-0889. PMC  2773075. PMID  19755544.
  15. ^ „David Fell - Citace Google Scholar“. scholar.google.no. Citováno 2018-09-25.

externí odkazy