David Bartel - David Bartel

David P. Bartel
Národnostamerický
Alma materGoshen College, Harvardská Univerzita
Známý jakoMicroRNA
OceněníGrand Prix scientifique de la Fondation Louis D.(2005)
Cena NAS v molekulární biologii (2005)
Vědecká kariéra
PoleBiochemie, Molekulární biologie
InstituceWhitehead Institute, Massachusetts Institute of Technology
Doktorský poradceJack Szostak

David P. Bartel je americký molekulární biolog nejlépe známý pro svou práci na mikroRNA. Bartel je a Profesor z Biologie na Massachusetts Institute of Technology, Člen Whitehead Institute a vyšetřovatel Howard Hughes Medical Institute (HHMI).

Životopis

Bartel si vysloužil své B.A. vzdělání v oboru Biologie z Goshen College v roce 1982 a jeho Ph.D. vzdělání v oboru Virologie z Harvardská Univerzita v roce 1993 pod vedením mentora Jack W. Szostak.[1]

Zatímco byl v laboratoři Szostak, Bartel izoloval první ribozymy přímo z náhodné sekvence pomocí in vitro evoluce (mezi nimi ligáza třídy I).[2] Poté, co se osamostatnil na Whitehead Institute, dále vyvinul tento ribozym, aby fungoval jako RNA-dependentní RNA polymeráza, aby rozšířil primery na externí templáty RNA, čímž posílil teorii „světa světa“.[3][4]

Bartel později přesunul své výzkumné zaměření na biologii mikroRNA a zejména na pochopení jejich regulačních funkcí.[5] MicroRNA jsou krátké kousky RNA, dlouhé asi 22 nukleotidů, které tlumením genové exprese tlumí messengerové RNA (mRNA). Jeho laboratoř byla jednou ze tří, která zjistila, že zvířata mají mnoho z těchto malých regulačních RNA,[6][7][8] a jako první popsal mikroRNA v rostlinách.[9][10] Prostřednictvím své práce s mikroRNA vyvinul metodiku, která předpovídá jejich regulační cíle, a vytvořil webový nástroj TargetScan, což tyto předpovědi zpřístupňuje výzkumné komunitě.[11][12][13][14][15] Jeho výzkum také ukázal, že většina lidských mRNA je regulována mikroRNA a že mikroRNA převážně působí na snižování hladin svých cílů mRNA.[13][16]

Bartel také objevil několik dalších typů regulačních RNA, včetně heterochromatických siRNA, které umlčují DNA místo RNA.[17] Bartel navíc zkoumá role dlouhých nekódujících RNA (lncRNA) a to, jak nepřekládané oblasti a konce mRNA získávají a zprostředkovávají regulační jevy.[5]

Bartel je zakladatelem a vědeckým poradcem společnosti Alnylam Pharmaceuticals, společnosti, která začala v roce 2002 prosazovat „terapii RNAi (RNA interference) jako novou třídu inovativních léčiv“.[18]

V roce 2006 se Bartel umístil na druhém místě Thomson Reuters v „citovaném“ žebříčku v oblasti molekulární biologie / genetiky. Získal několik ocenění a byl zvolen do Národní akademie věd v roce 2011.[19]

Reference

  1. ^ „David P. Bartel '82“. Goshen Bulletin. 2007. Citováno 8. března 2014.
  2. ^ Věda. 10. září 1993; 261 (5127): 1411-8. "Izolace nových ribozymů z velké skupiny náhodných sekvencí "Bartel DP, Szostak JW.
  3. ^ Trends Cell Biol. 1999 prosinec; 9 (12): M9-M13. "Vytváření světa RNA "Bartel DP, Unrau PJ."
  4. ^ Johnston, WK; Unrau, PJ; Lawrence, MS; Glasner, ME; Bartel, DP (18. května 2001). „RNA-katalyzovaná RNA polymerace: přesné a obecné prodloužení primerů s templátem RNA“. Věda. 292 (5520): 1319–25. Bibcode:2001Sci ... 292.1319J. CiteSeerX  10.1.1.70.5439. doi:10.1126 / science.1060786. PMID  11358999. S2CID  14174984.
  5. ^ A b „David Bartel“. HHMI. Citováno 7. října 2016.
  6. ^ "Věda". 2001 26. října; 294 (5543): 853-8. "Identifikace nových genů kódujících malé exprimované RNA." Lagos-Quintana M1, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T.
  7. ^ "Věda". 2001 26. října; 294 (5543): 858-62. "Bohatá třída drobných RNA s pravděpodobnou regulační rolí v Caenorhabditis elegans "Lau NC1, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP."
  8. ^ "Věda". 2001 26. října; 294 (5543): 862-4. "Rozsáhlá třída malých RNA v Caenorhabditis elegans. Lee RC1, Ambros V.
  9. ^ „Genes Dev.“ 2002 1. července; 16 (13): 1616-26. "MicroRNA v rostlinách "Reinhart BJ1, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP."
  10. ^ "Buňka". 2002 23. srpna; 110 (4): 513-20. "Predikce cílů rostlinné mikroRNA "Rhoades MW1, Reinhart BJ, Lim LP, Burge CB, Bartel B, Bartel DP.
  11. ^ "Buňka". 2005 14. ledna; 120 (1): 15-20. "Zachované párování semen, často obklopené adenosiny, naznačuje, že tisíce lidských genů jsou cíle mikroRNA "Lewis BP, Burge CB, Bartel DP."
  12. ^ „Mol Cell“. 2007 6. července; 27 (1): 91-105. "Specifičnost cílení na mikroRNA u savců: determinanty nad párováním semen "Grimson A1, Farh KK, Johnston WK, Garrett-Engele P, Lim LP, Bartel DP."
  13. ^ A b „Genome Res.“ 2009 Jan; 19 (1): 92-105. "Většina savčích mRNA je konzervovaným cílem mikroRNA "Friedman RC1, Farh KK, Burge CB, Bartel DP."
  14. ^ Agarwal, Vikram; Bell, George W .; Nam, Jin-Wu; Bartel, David P. (08.08.2015). „Predikce účinných cílových míst mikroRNA v savčích mRNA“. eLife. 4: e05005. doi:10,7554 / eLife.05005. ISSN  2050-084X. PMC  4532895. PMID  26267216.
  15. ^ Agarwal, V; Subtelny, AO; Thiru, P; Ulitsky, I; Bartel, DP (4. října 2018). „Predikce účinnosti cílení mikroRNA u Drosophila“. Genome Biology. 19 (1): 152. doi:10.1186 / s13059-018-1504-3. PMC  6172730. PMID  30286781.
  16. ^ Guo, H; Ingolia, NT; Weissman, JS; Bartel, DP (12. srpna 2010). „Savčí mikroRNA převážně působí na snížení cílové hladiny mRNA“. Příroda. 466 (7308): 835–40. Bibcode:2010Natur.466..835G. doi:10.1038 / nature09267. PMC  2990499. PMID  20703300.
  17. ^ Reinhart, BJ; Bartel, DP (13. září 2002). "Malé RNA odpovídají centromérním heterochromatickým opakováním". Věda. 297 (5588): 1831. doi:10.1126 / science.1077183. PMID  12193644. S2CID  42288846.
  18. ^ „Vědecká poradní rada“. Alnylam.com. Citováno 5. října 2016.
  19. ^ „Člen Whitehead David Bartel zvolen do Národní akademie věd“. Citováno 25. ledna 2015.

externí odkazy