Soutěžní čip - Competition-ChIP

Soutěžní čip je varianta Sekvenování čipů protokol, který se používá k měření relativní dynamiky vazby transkripčního faktoru (TF) na DNA.[1] Vzhledem k tomu, že míry obsazení TF jsou považovány za špatný prediktor funkce TF v daném místě, je soutěžní čip mnohem silněji spojen s funkcí než obsazenost. Technika byla původně vyvinuta v Jason D. Lieb laboratoř v roce 2011.

Reference

  1. ^ Lieb, Jason D. (2013). „Měření dynamiky vazby protein-DNA v celém genomu pomocí konkurenčního čipu“. Nat. Protoc. 8 (7): 1337–53. doi:10.1038 / nprot.2013.077.