Charles Ofria - Charles Ofria

Charles Ofria
narozený (1973-12-13) 13. prosince 1973 (věk 46)
New York, NY (Spojené státy)
Státní občanstvíSpojené státy
Alma materUniverzita Stony Brook (BS, 1994)
Kalifornský technologický institut (Ph.D., 1999)
Známý jakoDigitální evoluce, Avida
OceněníAward Withrow Distinguished Scholar (2006, 2016)[1]
Cena NSF CAREER (2007)
Cena Withrow Teaching Excellence Award (2010)[2]
Vědecká kariéra
PolePočítačová věda, evoluční biologie
InstituceMichiganská státní univerzita
Doktorský poradceChristoph Adami
Ostatní akademičtí poradciRichard Lenski
webová stránkawww.fria.com

Dr. Charles A. Ofria je profesorem na katedře počítačů a vědy na Michiganská státní univerzita, ředitel Laboratoř Digital Evolution (DEvo) tam a ředitel Centrum BEACON pro studium evoluce v akci. Je synem zesnulého Charlese Ofria,[3] kdo vyvinul první plně integrovaný prodejna program řízení pro automobilový opravárenský průmysl. Ofria se zúčastnila Stuyvesant High School a absolvoval Ward Melville High School v roce 1991. Získal titul B.S. v informatice, čisté matematice a aplikované matematice z Univerzita Stony Brook v roce 1994 a titul Ph.D. ve výpočtových a neuronových systémech z Kalifornský technologický institut v roce 1999. Výzkum společnosti Ofria se zaměřuje na souhru mezi počítačová věda a darwinovskou evoluci.[4]

Ofria je jedním z návrhářů společnosti Avida, an umělý život softwarová platforma pro studium evoluční biologie samoreplikujících a vyvíjejících se počítačových programů (digitální organismy, viz také Simulátory digitálních organismů ). Avida byla široce používána ke studiu základních procesů, které jsou základem darwinovské evoluce.[5] Avida je v aktivním vývoji v Ofria's Digital Evolution Lab v Michiganská státní univerzita a byl původně navržen Ofria, Chris Adami a C. Titus Brown v Caltech v roce 1993.

Vyznamenání

Ofria získala cenu NSF Career Award v roce 2007[6] a cenu Withrow Excellence Award za vynikající výsledky ve výuce v roce 2010[7] a za vynikající výsledky ve výzkumu v letech 2006 a 2016.[8] Byl také vítězem ceny za vynikající fakultu Williama J. Beala za rok 2017.[9]

Reprezentativní časopisové publikace

  • Clune J, Pennock RT, Ofria C, Lenski RE (2012) Ontogeny inklinuje k rekapitulaci fylogeneze v digitálních organismech “ Americký přírodovědec 180: E54 – E63. (pdf )
  • Clune J, Goldsby HJ, Ofria C a Pennock RT (2011) Selektivní tlaky pro přesné cílení altruismu: Důkazy z digitální evoluce pro obtížně testovatelné aspekty teorie inkluzivního fitness. Sborník Královské společnosti. 278: 666-674. (PDF )
  • Clune J, Stanley KO, Pennock RT, Ofria C (2011) O výkonu nepřímého kódování napříč kontinuem pravidelnosti. Transakce IEEE na evolučním výpočtu. 15 (3): 346-367. (PDF )
  • Clune J, Misevic D, Ofria C, Lenski RE, Elena SF a Sanjuán R. Přirozený výběr nedokáže optimalizovat rychlost mutací pro dlouhodobou adaptaci na drsné fitness krajiny[10]
  • Ofria C, Huang W a Torng E. O postupném vývoji složitosti a náhlém vzniku komplexních rysů[11]
  • Elena SF, Wilke CO, Ofria C a Lenski RE. Účinky velikosti populace a rychlosti mutací na vývoj mutační robustnosti[12]
  • Ostrowski E, Ofria C a Lenski RE, Ekologická specializace a adaptivní rozpad digitálních organismů[13]
  • Lenski RE, Barrick JE, Ofria C. Balancing Robustness and Evolvability[14]
  • Misevic D, Ofria C a Lenski RE. Sexuální reprodukce přetváří genetickou architekturu digitálních organismů[15]

Vybrané vědecké publikace představující Avidu

  • R. E. Lenski C. Ofria, T. C. Collier, C. Adami (1999). Genomická složitost, robustnost a genetické interakce v digitálních organizmech. Příroda 400:661-664. Abstraktní
  • C. Adami, C. Ofria a T.C. Collier (2000). Vývoj biologické složitosti. „Sborník Národní akademie věd“ 97:4463-4468. Abstraktní
  • C. O. Wilke, J. L. Wang, C. Ofria, R. E. Lenski, a C. Adami (2001). Vývoj digitálních organismů při vysoké rychlosti mutace vede k přežití toho nejploššího. Příroda 412:331-333 Abstraktní.
  • R. E. Lenski, C. Ofria, R. T. Pennock, a C. Adami (2003). Evoluční původ složitých funkcí. Příroda 423:139-145. Abstraktní
  • S.S. Chow, C.O. Wilke, C. Ofria, R. E. Lenski a C. Adami (2004). Adaptivní záření z konkurence zdrojů v digitálních organizmech. Věda 305:84-86 Abstraktní.

Reference

  1. ^ „Ofria a Owen dostávají Withrow Awards“. Michiganská státní univerzita. Archivovány od originál dne 4. června 2016. Citováno 2. října 2017.
  2. ^ „Ofria a Tan dostávají Withrowova ocenění“. Michiganská státní univerzita. Archivovány od originál dne 25. března 2015. Citováno 2. října 2017.
  3. ^ „Charles Ofria (senior)“. FamilyCar.com. Archivovány od originál dne 8. února 2013. Citováno 11. prosince 2011.
  4. ^ Počítačová věda Michiganská státní univerzita
  5. ^ „Testování Darwina“. Objevte časopis. Únor 2005.
  6. ^ „Charles Ofria získává cenu NSF CAREER“. Michiganská státní univerzita. 2007. Archivovány od originál dne 06.04.2012.
  7. ^ „Ofria a Tan dostávají ocenění Withrow Awards“. 2010.
  8. ^ „Jain, Ofria a Stirewalt vyhrávají Withrow Awards“. 2006.
  9. ^ „2017 William J. Beal Vynikající fakultní ceny“. 2017.
  10. ^ Clune, J; Misevic, D; Ofria, C; Lenski, RE; Elena, SF; Sanjuán, R (2008). „Přirozený výběr selhává při optimalizaci rychlostí mutací pro dlouhodobou adaptaci na drsné krajiny s fitness“. PLOS výpočetní biologie. 4 (9): e1000187. Bibcode:2008PLSCB ... 4E0187C. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000187. PMC  2527516. PMID  18818724.
  11. ^ Ofria, Charles; Huang, Wei; Torng, Eric (2007). „O postupném vývoji složitosti a náhlém vzniku složitých funkcí“. Umělý život. 14 (3): 255–263. doi:10.1162 / artl.2008.14.3.14302. PMID  18489251.
  12. ^ Elena, Santiago F .; Wilke, Claus O .; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Účinky velikosti populace a rychlosti mutace na vývoj mutační robustnosti". Vývoj. 61 (3): 666–674. doi:10.1111 / j.1558-5646.2007.00064.x. PMID  17348929.
  13. ^ Ostrowski, Elizabeth A .; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Ekologická specializace a adaptivní úpadek v digitálních organizmech". Americký přírodovědec. 169 (1): E1–20. doi:10.1086/510211. JSTOR  10.1086/510211. PMID  17206577.
  14. ^ Lenski, RE; Barrick, JE; Ofria, C (2006). „Vyvážení robustnosti a evolučnosti“. PLOS Biology. 4 (12): e428. doi:10.1371 / journal.pbio.0040428. PMC  1750925. PMID  17238277.
  15. ^ Misevic, Dušan; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2005). „Sexuální reprodukce přetváří genetickou architekturu digitálních organismů“. Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy. 273 (1585): 457–464. doi:10.1098 / rspb.2005.3338. PMC  1560214. PMID  16615213.

externí odkazy