Candidatus Carsonella ruddii - Candidatus Carsonella ruddii

Candidatus Carsonella ruddii
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Gama proteobakterie
Objednat:
nezařazeno
Rod:
Candidatus Carsonella
Druh:
Ca. C. ruddii
Binomické jméno
Candidatus Carsonella ruddii
Thao a kol. 2000

Candidatus Carsonella ruddii je povinná endosymbiotikum Gamma Proteobacterium[1] s jedním z nejmenších genomy jakékoli charakterizované bakterie.[2]

Endosymbióza

Druh je endosymbiont který je přítomen u všech druhů phloem míza živící se hmyz známý jako psyllidy.[3][4] Endosymbionty se vyskytují ve specializované struktuře známé jako bakteriom.

C. ruddii není zcela parazitický ve vztahu k hostitelskému hmyzu; dodává hostiteli některé esenciální aminokyseliny. Je tedy pravděpodobně v evolučním procesu stávání se organela, podobně jako mitochondrie eukaryotických buněk, které se také vyvinuly z endosymbiontu.[5]

Genom

V roce 2006 genom Ca. Kmen C. ruddii Pv (Carsonella-Pv) z hackberry řapík gall psyllid, Pachypsylla venusta, bylo sekvenováno v RIKEN v Japonsku a University of Arizona. Ukázalo se, že genom se skládá z kruhového chromozomu 159 662 základní páry a že má vysokou hustotu kódování (97%) s mnoha překrývající se geny a snížená délka genu. Počet předpokládaných geny bylo 182, také nejnižší v záznamu (NCBI-genom ). V porovnání, Mycoplasma genitalium, který má nejmenší genom ze všech volně žijících organismů, má genom 521 genů. Zdá se, že chybí četné geny považované za nezbytné pro život, což naznačuje, že tento druh mohl dosáhnout organela -jako stav.[2]

V době jeho sekvenování se předpokládalo, že C. ruddii má nejmenší genom ze všech charakterizovaných bakteriálních druhů.[6] Nasuia deltocephalinicola se nyní považuje za známý nejmenší bakteriální genom (112kb).[7]

C. ruddii a příbuzné druhy se zdají být aktivně podstupovány ztráta genu.[8]

Reference

  1. ^ Spaulding, A. W .; von Dohlen, C. D. (1998). "Fylogenetická charakterizace a molekulární evoluce bakteriálních endosymbiontů v psyllidech (Hemiptera: Sternorrhyncha)". Molekulární biologie a evoluce. 15 (11): 1506–1513. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025878. PMID  12572614.
  2. ^ A b Nakabachi A, Yamashita A, Toh H, Ishikawa H, Dunbar H, Moran N, Hattori M (2006). „160kbázový genom bakteriálního endosymbionta Carsonella“. Věda. 314 (5797): 267. doi:10.1126 / science.1134196. PMID  17038615.
  3. ^ Thao, M.L. (2000). „Cospeciation of Psyllids and their Primary Prokaryotic Endosymbionts“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 66 (7): 2898–2905. doi:10.1128 / aem.66.7.2898-2905.2000. PMC  92089. PMID  10877784.
  4. ^ Thao, M.L. (2001). „Fylogenetická analýza vertikálně přenášených psyllidových endosymbiontů (Candidatus Carsonella ruddii) na základě atpAGD a rpoC: srovnání s fylogenezí odvozenou od 16S-23S rDNA“. Současná mikrobiologie. 42 (6): 419–21. doi:10,1007 / s002840010240. PMID  11381334.
  5. ^ Tortora (1), Funke (2), Case (3), Gerard J (1), Berdell R (2), Christine L (3) (2016). Microbiology: An Introduction (12. vydání). USA: Pearson. p. 315. ISBN  978-0321929150.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  6. ^ Moran, Nancy A .; Bennett, Gordon M. (8. září 2014). "Nejmenší drobné genomy". Výroční přehled mikrobiologie. 68 (1): 195–215. doi:10.1146 / annurev-micro-091213-112901. PMID  24995872.
  7. ^ Bennett, G. M .; Moran, N.A. (5. srpna 2013). „Malý, menší, nejmenší: Počátky a vývoj starodávných duálních symbióz v hmyzu živícím se lémem“. Biologie genomu a evoluce. 5 (9): 1675–1688. doi:10.1093 / gbe / evt118. PMC  3787670. PMID  23918810.
  8. ^ Sloan, D. B .; Moran, N.A. (19. července 2012). „Redukce genomu a společná evoluce mezi primárními a sekundárními bakteriálními symbionty psyllidů“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (12): 3781–3792. doi:10,1093 / molbev / mss180. PMC  3494270. PMID  22821013.

externí odkazy