Brix (databáze) - Brix (database)
![]() | |
---|---|
Obsah | |
Popis | databáze proteinových fragmentů |
Kontakt | |
Výzkumné centrum | Univerzita v Bruselu |
Laboratoř | Laboratoř VIB SWITCH |
Primární citace | PMID 20972210 |
Datum vydání | 2010 |
Přístup | |
webová stránka | http://brix.crg.es |
BriX je databáze obsahující některé protein fragmenty od 4 do 14 zbytků z nehomologní proteiny.[1]
V Brixu je zaregistrováno velmi málo smyček, takže k vyřešení tohoto problému byla do systému přidána Loop Brix, která pomáhá strukturovat nepravidelné prvky. Ty jsou organizovány se shlukováním prvků typu end to end a jejich vzdáleností mezi zbytky, které lemují horní část peptid. V současné době systém také doporučuje, aby byly nahrány struktury odeslané uživatelem, pokud odpovídají třídám Brix.[2]
Viz také
Reference
- ^ Vanhee, Peter; Verschueren Erik; Baeten Lies; Stricher Francois; Serrano Luis; Rousseau Frederic; Schymkowitz Joost (leden 2011). „BriX: databáze stavebních bloků bílkovin pro strukturní analýzu, modelování a návrh“. Nucleic Acids Res. Anglie. 39 (Problém s databází): D435-42. doi:10.1093 / nar / gkq972. PMC 3013806. PMID 20972210.
- ^ "Brix přehled". Neobiolab. 28. července 2013. Citováno 3. srpna 2015.
externí odkazy
![]() | Tento Biologická databáze související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |