Betasphaerolipovirus - Betasphaerolipovirus - Wikipedia

Virus natrinema SNJ1
Klasifikace virů
(bez hodnocení):	Virus
Oblast:	Varidnaviria
Království:	Helvetiavirae
Kmen:	Dividoviricota
Třída:	Laserviricetes
Objednat:	Halopanivirales
Rodina:	Sphaerolipoviridae
Rod:	Betasphaerolipovirus
Druh:	Virus natrinema SNJ1

Betasphaerolipovirus je rod dvouvláknových DNA virů, které infikují haloarchaea.^[1] Natrinema virus SNJ1 je druh typu a v současné době jediný člen rodu.

Morfologie

Viry tohoto rodu mají icosahedrální viriony bez ocasů s vnitřní lipidovou membránou umístěnou mezi proteinovou kapsidou a kruhovým genomem dvouřetězcové DNA.

Replikace

Mírný haloarcheální virus SNJ1 vykazuje lytické a lysogenní životní cykly. Během lysogenního cyklu virus sídlí ve svém hostiteli, Natrinema sp. J7-1, ve formě extrachromozomálního cirkulárního plazmidu. Po indukci mitomycinem C může být produkováno velké množství virionů SNJ1.^[2] Genom SNJ1 se replikuje mechanismem klouzavého kruhu a je iniciován virem kódovaným proteinem RepA, který je homologní s proteiny iniciace replikace archaealních plazmidů a bakteriálních transpozáz rodiny IS91 vkládací sekvence.^[3]^[4] Virus se uvolňuje lýzou infikovaných buněk.

Reference

^ Pawlowski A, Rissanen I, Bamford JK, Krupovic M, Jalasvuori M (2014). „Gammasphaerolipovirus, nově navržený rod bakteriofágů, sjednocuje viry halofilních archea a termofilních bakterií v nové rodině Sphaerolipoviridae“. Arch Virol. 159 (6): 1541–1554. doi:10.1007 / s00705-013-1970-6. PMID 24395078.
^ Zhang, Z; Liu, Y; Wang, S; Yang, D; Cheng, Y; Hu, J; Chen, J; Mei, Y; Shen, P; Bamford, DH; Chen, X (2012). „Mírný membránový halofilní archaální virus SNJ1 má kruhový genom dsDNA identický s genomem plazmidu pHH205“. Virologie. 434 (2): 233–41. doi:10.1016 / j.virol.2012.05.036. PMID 22784791.
^ Wang, Yuchen; Chen, Beibei; Cao, Mengzhuo; Sima, Linshan; Prangishvili, David; Chen, Xiangdong; Krupovic, Mart (2018). „Protein pro iniciaci replikace klouzavého kruhu haloarchaeal sphaerolipovirus SNJ1 je homologní s bakteriálními transpozázami inzertních sekvencí rodiny IS91“ (PDF). Journal of General Virology. 99 (3): 416–421. doi:10.1099 / jgv.0.001009. PMID 29458508.
^ Wang, Y; Sima, L; Lv, J; Huang, S; Liu, Y; Wang, J; Krupovic, M; Chen, X (2016). „Identifikace, charakterizace a aplikace oblasti replikonu halofilního mírného sphaerolipoviru SNJ1“. Journal of Bacteriology. 198 (14): 1952–64. doi:10.1128 / JB.00131-16. PMC 4936101. PMID 27137505.

[1] Pawlowski A, Rissanen I, Bamford JK, Krupovic M, Jalasvuori M (2014). „Gammasphaerolipovirus, nově navržený rod bakteriofágů, sjednocuje viry halofilních archea a termofilních bakterií v nové rodině Sphaerolipoviridae“. Arch Virol. 159 (6): 1541–1554. doi:10.1007 / s00705-013-1970-6. PMID 24395078.

[2] Zhang, Z; Liu, Y; Wang, S; Yang, D; Cheng, Y; Hu, J; Chen, J; Mei, Y; Shen, P; Bamford, DH; Chen, X (2012). „Mírný membránový halofilní archaální virus SNJ1 má kruhový genom dsDNA identický s genomem plazmidu pHH205“. Virologie. 434 (2): 233–41. doi:10.1016 / j.virol.2012.05.036. PMID 22784791.

[3] Wang, Yuchen; Chen, Beibei; Cao, Mengzhuo; Sima, Linshan; Prangishvili, David; Chen, Xiangdong; Krupovic, Mart (2018). „Protein pro iniciaci replikace klouzavého kruhu haloarchaeal sphaerolipovirus SNJ1 je homologní s bakteriálními transpozázami inzertních sekvencí rodiny IS91“ (PDF). Journal of General Virology. 99 (3): 416–421. doi:10.1099 / jgv.0.001009. PMID 29458508.

[4] Wang, Y; Sima, L; Lv, J; Huang, S; Liu, Y; Wang, J; Krupovic, M; Chen, X (2016). „Identifikace, charakterizace a aplikace oblasti replikonu halofilního mírného sphaerolipoviru SNJ1“. Journal of Bacteriology. 198 (14): 1952–64. doi:10.1128 / JB.00131-16. PMC 4936101. PMID 27137505.

[1]

[2]

[3]

[4]