Benzoát: H symportér - Benzoate:H symporter - Wikipedia

The benzoát: rodina H symporter (BenE) (TC # 2.A.46 ) je členem Nadčeleď APC. Rodina BenE obsahuje pouze dva funkčně charakterizované a seřazené členy, permeáty benzoátu z Acinetobacter calcoaceticus a E-coli. Tyto proteiny mají délku asi 400 zbytků a pravděpodobně překlenují membránu 12krát. Někteří členové rodiny BenE mohou mít pouhých 7 TMS (tj. BenE z Frankia sp. Ccl3; TC # 2.A.46.1.6 ), nebo až 14 TMS (tj. BenE z Cellvibrio gilvus; TC # 2.A.46.1.4 ). Členové rodiny BenE vykazují přibližně 30% vzájemnou identitu a omezenou sekvenční podobnost s členy rodiny Aromatic Acid: H Symporter (AAHS) (TC # 2.A.1.15 ) z Nadčeleď hlavních facilitátorů (MFS). Stupeň podobnosti s posledně uvedenými proteiny je nedostatečný pro stanovení homologie.[1][2] Počátkem roku 2016 nejsou pro členy rodiny BenE k dispozici žádná krystalová strukturní data.

Transportní reakce

Zobecněná transportní reakce katalyzovaná BenE z A. calcoaceticus je:[2]

Benzoát (out) + H+ (out) → benzoát (in) + H+ (v).

Reference

  1. ^ Epling-Burnette, Pearlie K .; Bai, Fanqi; Painter, Jeffrey S .; Rollison, Dana E .; Salih, Helmut R .; Krusch, Matthias; Zou, JianXiang; Ku, Edna; Zhong, Bin (01.06.2007). „Snížená funkce přirozeného zabijáka (NK) spojená s vysoce rizikovým myelodysplastickým syndromem (MDS) a snížená exprese aktivujících NK receptorů“. Krev. 109 (11): 4816–4824. doi:10.1182 / krev-2006-07-035519. ISSN  0006-4971. PMC  1885518. PMID  17341666.
  2. ^ A b Saier, MH ml. „2.A.46 Rodina Benzoate: H Symporter (BenE)“. Databáze klasifikace transportérů. Saier Lab Bioinformatics Group @ UCSD / SDSC.