Ben Langmead - Ben Langmead - Wikipedia
Ben Langmead | |
|---|---|
| narozený | Benjamin Thomas Langmead |
| Alma mater | |
| Známý jako | Zarovnávač sekvence motýlek |
| Ocenění | Cena Benjamina Franklina (2016) |
| Vědecká kariéra | |
| Pole | Výpočetní biologie |
| Instituce | Univerzita Johna Hopkinse |
| Teze | Algoritmy a vysoce výkonné výpočetní přístupy pro srovnávací genomiku založenou na sekvenování (2012) |
| Doktorský poradce | Steven Salzberg |
| webová stránka | www |
Ben Langmead je výpočetní biolog a docent ve Computational Biology & Medicine Group ve společnosti Univerzita Johna Hopkinse.[1][2]
Vzdělávání
Langmead získal jeho Bakalář umění vzdělání v oboru počítačová věda z Columbia College, Columbia University v roce 2003. Získal oba své Mistr vědy a PhD v oboru počítačových věd z University of Maryland, kontrolován Steven Salzberg v letech 2009 a 2012.[3]
Kariéra
Langmead je známý pro vývoj Motýlek zarovnání sekvence algoritmus,[4] který implementuje Burrows – Wheelerova transformace za účelem zlepšení škálovatelnosti zarovnání sekvence. Od roku 2017[Aktualizace], originál Genome Biology článek, který popisuje softwarový balíček Bowtie, byl citován více než 9 000krát.
Langmead se stal asistentem na univerzitě Johns Hopkins University v červenci 2012.[3]
Ocenění
Langmead byl oceněn Cena Benjamina Franklina v roce 2016 za propagaci bezplatných a otevřených materiálů pro použití v přírodních vědách.[5]
Reference
- ^ „Benjamin Langmead - Ústav výpočetní techniky“. Ústav výpočetní techniky. Citováno 23. března 2017.
- ^ Ben Langmead publikace indexované podle Google Scholar
- ^ A b „Langmead CV“ (PDF). Citováno 24. března 2017.
- ^ Langmead, Ben; Trapnell, Cole; Pop, Mihai; Salzberg, Steven L (2009). „Ultrarychlé a paměťově efektivní zarovnání krátkých sekvencí DNA do lidského genomu“. Genome Biology. 10 (3): R25. doi:10.1186 / gb-2009-10-3-r25. PMC 2690996. PMID 19261174.
- ^ „Cena Benjamina Franklina - Bioinformatics.org“. www.bioinformatics.org. Citováno 23. března 2017.
externí odkazy
Kontrolní úřad  |
|---|