Anindya Dutta - Anindya Dutta

Anindya Dutta
Alma materChristian Medical College, Vellore (MBBS),

Rockefellerova univerzita (PhD)

Cold Spring Harbor Laboratory (postdoktorand)

BWH, Harvard Medical School (sídlo)
OceněníRanbaxy Award (SunPharma)

Vynikající cena vyšetřovatele (ASIP)

Cena Distinguished Scientist Award (University of Virginia)
Vědecká kariéra
PoleBiochemie, biologie rakoviny
InstituceNemocnice Brigham and Women’s, Harvard Medical School, University of Virginia School of Medicine

Anindya Dutta je indický americký biochemik a výzkumník rakoviny, který pracoval jako předseda katedry biochemie a molekulární genetiky na Lékařská fakulta University of Virginia od roku 2011. Výzkum společnosti Dutta se zaměřuje na buněčný cyklus savců s důrazem na replikaci a opravu DNA a na nekódující RNA. Zvláště se zajímá o to, jak deregulace těchto procesů podporuje progresi rakoviny. Za své úspěchy byl zvolen a Člen Americké asociace pro pokrok ve vědě,[1] obdržel Cenu Ranbaxy v biomedicínských vědách, cenu Vynikající vyšetřovatele od Americká společnost pro vyšetřovací patologii Ocenění Distinguished Scientist Award od University of Virginia a cenu Mark Brothers Award od Lékařská fakulta univerzity v Indianě.

Životopis

Dutta se narodil v Kalkatě v Indii. Zúčastnil se Vyšší střední škola svatého Patrika v Asansolu (1966 až 1974) a titul MBBS získal od Christian Medical College & Hospital, Vellore, kterou ukončil jako nejlepší odcházející student v roce 1982. Po roce jako výzkumný asistent na Indický institut chemické biologie, Kalkata, zapsal se na Rockefellerova univerzita v New Yorku pro doktorské studium u Hidesaburo Hanafusa pracovat na virální onkologii. Získal titul Ph.D. v roce 1989.

Vstoupil do laboratoře Bruce Stillman na Cold Spring Harbor Laboratory dělat postdoktorský výzkum regulace buněčného cyklu replikace DNA. V roce 1992 zahájil pobyt v Anatomic Pathology at Brigham and Women's Hospital, Harvardská lékařská škola, kde se stal asistentem a poté docentem patologie. V roce 2003 byl jmenován profesorem biochemie a molekulární genetiky Harryho F. Byrda na Lékařské fakultě University of Virginia.

Dutta zjistil, jak faktor p21 buněčného cyklu interaguje s inhibuje cyklin-dependentní kinázy a PCNA, a identifikuje cyklický vazebný motiv Cy nebo RXL, který také používá cdk k identifikaci substrátů pro fosforylaci.[2][3][4] Objevil, jak interakce p21, Cdt1, Set8 a dalších důležitých regulátorů buněčného cyklu s PCNA spouští jejich ubikvitylaci pomocí CRL4-Cdt2 a následnou degradaci proteazomu.[5][6][7][8] Jeho laboratoř klonovala cDNA mnoha faktorů iniciace replikace lidské DNA a jejich regulátorů (Orc3, Orc4, Orc5, Orc6, Cdc6, Cdt1, Cdc45, Mcm10, geminin) [9][10] a identifikovali, jak je rovnováha geminin-Cdt1 důležitá pro prevenci nad replikace v lidských buňkách.[11][12][13][14] Tyto objevy vysvětlily, jak nový experimentální protirakovinový lék MLN4924 (Pevonedistat ) způsobil nadměrnou replikaci DNA a poškození DNA vedoucí ke smrti rakovinných buněk. Laboratoř objevila E2 v cestě Fanconiho anémie, UBE2T, o které je nyní známo, že způsobuje Fanconiho anémii (FANCT).[15] Při včasném přijetí genomových technologií v rámci pilotního projektu ENCODE laboratoř společnosti Dutta molekulárně identifikovala domény lidských chromozomů, které se replikovaly brzy nebo pozdě v S fázi, a ukázala, že odpovídají chromozomálním doménám s aktivními nebo represivními epigenetickými značkami.[16] Potvrdil, že většina počátků replikace v lidských buňkách se jeví jako zóny s více iniciačními místy, která jsou v dané buňce v populaci buněk neúčinně využívána.[17] Laboratoř objevila desítky tisíc extrachromozomálních kruhů DNA (microDNA) v normálních a rakovinných buňkách a v tkáních u lidí, myší a kuřat a somaticky mozaikové chromozomální mikrodelece v některých hotspotech produkce mikroDNA.[18] MikroDNA se uvolňuje do oběhu a přidá do repertoáru bezbuněčné cirkulující DNA, která se používá pro tekutou biopsii u rakoviny a v prenatálních neinvazivních genetických diagnózách.[19] Nakonec laboratoř objevila, jak delece genů MCM9 a ASF1a u některých lidských rakovin činí rakovinné buňky náchylné k terapii vyvolávající poškození DNA [20] a že deubikvitináza USP46 by měla být zaměřena na terapii rakoviny způsobené lidským papilomavirem.[21]

V oblasti nekódujících RNA objevila Dutta roli mikroRNA jako miR-206 a dlouhých nekódujících RNA (lncRNA) jako H19 a MUNC při podpoře diferenciace a regenerace kosterního svalstva po poranění.[22][23][24] Skupina identifikovala role několika mikroRNA v tumorigenezi [25] a skóre dlouhých nekódujících RNA, jejichž hladiny exprese předpovídají výsledek gliomů (např. DRAIC, LINC00152 nebo APTR), a navrhuje, že pro expresi mohou být použity vzorce exprese lncRNA pro prognostické účely.[26] Dutta identifikoval novou rodinu krátkých RNA odvozených ze zpracování tRNA, nazývanou tRF. tRF se stávají univerzálními regulátory buněčných funkcí, přičemž některé regulují expresi buněčných genů pomocí cest podobných mikroRNA, přestože nejsou generovány enzymy, které normálně generují mikroRNA [27][28][29]

Vyznamenání a ocenění

  • National Merit Scholar, National Science Talent Scholar, India (1975)
  • Nejlepší odcházející student, Christian Medical College, Vellore, Indie (1981)
  • Postdoctoral Fellowship (1990), Junior Faculty Award (1993) and Research Scholar Award (2001), Americká rakovinová společnost
  • Award Career Development Award, US Army Breast Cancer Research Programme (1994)
  • Fellow, American Association for the Advancement of Science (2007)
  • Cena Ranbaxy Research v základní biomedicínské vědě (2009)
  • Harry F. Byrd Professor (2003-2018), Harrison Distinguished Professor (2018-), Millipub Award for papers with> 1000 citations (2012), Team Science Award (2012), Distinguished Scientist Award (2015), University of Virginia
  • Vynikající cena pro vyšetřovatele, Americká společnost pro vyšetřovací patologii (2015)
  • Mark Brothers Award, Indiana University School of Medicine (2016)

Profesionální činnosti

Přes Duttovu laboratoř prošlo více než 75 praktikantů (postdoktorandů, doktorandů a doktorandů), z nichž více než 30 v současné době zastává nezávislé pozice provádějící výzkum v akademické nebo průmyslové sféře. Jako předseda katedry biochemie a molekulární genetiky najal devět členů fakulty a vytvořil oddělení zaměřené na výzkum v oddělení epigenetiky a genomiky rakoviny. Dutta pracoval jako redaktor časopisu Journal of Biological Chemistry a jako vedoucí redaktor výzkumu rakoviny. Působil jako recenzent v National Institutes of Health, U.S. Armed Forces Cancer Research Program, Cancer Research UK, Wellcome Trust UK, CNRS / INSERM France, Austrian Science Fund, European Union's FP7 program, DBT-Wellcome Trust India Alliance, Ústav pro základní vědu (Korea) a ve výboru pro externí kontrolu pro Oklahoma Medical Research Foundation a pro Univerzita Thomase Jeffersona. Dutta byl zvolen k uspořádání dvou konferencí Gordonova výzkumu o proliferaci buněk a stabilitě genomu a uspořádal tři setkání laboratoře Cold Spring Harbor týkající se replikace eukaryotické DNA a údržby genomu. Působil v programových výborech pro výroční zasedání Americká společnost pro vyšetřovací patologii a Americká společnost pro biochemii a molekulární biologii.

Reference

  1. ^ „Výroční zpráva AAAS za rok 2007“ (PDF). Americká asociace pro rozvoj vědy. p. 22.
  2. ^ Chen, J; Jackson, PK; Kirschner, MW; Dutta, A (23. března 1995). "Samostatné domény p21 zapojené do inhibice Cdk kinázy a PCNA". Příroda. 374 (6520): 386–8. Bibcode:1995 Natur.374..386C. doi:10.1038 / 374386a0. PMID  7885482.
  3. ^ Takeda, DY; Wohlschlegel, JA; Dutta, A (19. ledna 2001). „Motiv pro rozpoznávání bipartitních substrátů pro cyklin-dependentní kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (3): 1993–7. doi:10,1074 / jbc.M005719200. PMID  11067844.
  4. ^ Chen, J; Saha, P; Kornbluth, S; Dynlacht, BD; Dutta, A (září 1996). „Motivy vázající cyklin jsou nezbytné pro funkci p21CIP1“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (9): 4673–82. doi:10.1128 / MCB.16.9.4673. PMC  231467. PMID  8756624.
  5. ^ Abbas, T; Shibata, E; Park, J; Jha, S; Karnani, N; Dutta, A (8. října 2010). „CRL4 (Cdt2) reguluje buněčnou proliferaci a expresi histonového genu zaměřením na PR-Set7 / Set8 pro degradaci“. Molekulární buňka. 40 (1): 9–21. doi:10.1016 / j.molcel.2010.09.014. PMC  2966975. PMID  20932471.
  6. ^ Abbas, T; Dutta, A (červen 2009). „p21 v rakovině: složité sítě a rozmanité aktivity“. Recenze přírody. Rakovina. 9 (6): 400–14. doi:10.1038 / nrc2657. PMC  2722839. PMID  19440234.
  7. ^ Abbas, T; Sivaprasad, U; Terai, K; Amador, V; Pagano, M; Dutta, A (15. září 2008). „PCNA-závislá regulace ubikvitilace a degradace p21 prostřednictvím ubikvitinového komplexu CRL4Cdt2“. Geny a vývoj. 22 (18): 2496–506. doi:10.1101 / gad.1676108. PMC  2546691. PMID  18794347.
  8. ^ Senga, T; Sivaprasad, U; Zhu, W; Park, JH; Arias, EE; Walter, JC; Dutta, A (10. března 2006). „PCNA je kofaktorem pro degradaci Cdt1 pomocí N-terminální ubikvitinace zprostředkované CUL4 / DDB1“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (10): 6246–52. doi:10,1074 / jbc.M512705200. PMID  16407252.
  9. ^ Bell, SP; Dutta, A (2002). "Replikace DNA v eukaryotických buňkách". Roční přehled biochemie. 71: 333–74. doi:10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135425. PMID  12045100.
  10. ^ Dhar, SK; Yoshida, K; Machida, Y; Khaira, P; Chaudhuri, B; Wohlschlegel, JA; Leffak, M; Yates, J; Dutta, A (10. srpna 2001). „Replikace viru Epstein-Barr z oriP vyžaduje lidskou ORC a je inhibována gemininem“. Buňka. 106 (3): 287–96. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00458-5. PMID  11509178.
  11. ^ Machida, YJ; Dutta, A (15. ledna 2007). „Inhibitor APC / C, Emi1, je nezbytný pro prevenci reereplikace“. Geny a vývoj. 21 (2): 184–94. doi:10.1101 / gad.1495007. PMC  1770901. PMID  17234884.
  12. ^ Machida, YJ; Hamlin, JL; Dutta, A (7. října 2005). "Správné místo, správný čas a pouze jednou: zahájení replikace v metazoanech". Buňka. 123 (1): 13–24. doi:10.1016 / j.cell.2005.09.019. PMID  16213209.
  13. ^ Vaziri, C; Saxena, S; Jeon, Y; Lee, C; Murata, K; Machida, Y; Wagle, N; Hwang, DS; Dutta, A (duben 2003). "Cesta kontrolního bodu závislá na p53 zabraňuje opětovné replikaci". Molekulární buňka. 11 (4): 997–1008. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00099-6. PMID  12718885.
  14. ^ Wohlschlegel, JA; Dwyer, BT; Dhar, SK; Cvetic, C; Walter, JC; Dutta, A (22. prosince 2000). "Inhibice eukaryotické replikace DNA vazbou gemininu na Cdt1". Věda. 290 (5500): 2309–12. Bibcode:2000 sci ... 290,2309 W.. doi:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID  11125146.
  15. ^ Machida, YJ; Dutta, A (15. ledna 2007). „Inhibitor APC / C, Emi1, je nezbytný pro prevenci reereplikace“. Geny a vývoj. 21 (2): 184–94. doi:10.1101 / gad.1495007. PMC  1770901. PMID  17234884.
  16. ^ ENCODE Project, Consortium .; Birney, E.; Stamatoyannopoulos, JA; Dutta, A; Guigó, R; Gingeras, TR; Margulies, EH; Weng, Z; Snyder, M; Dermitzakis, ET; Thurman, RE; Kuehn, MS; Taylor, CM; Neph, S; Koch, CM; Asthana, S; Malhotra, A; Adzhubei, I; Greenbaum, JA; Andrews, RM; Flicek, P; Boyle, PJ; Cao, H; Carter, NP; Clelland, GK; Davis, S; Den, N; Dhami, P; Dillon, SC; et al. (14. června 2007). „Identifikace a analýza funkčních prvků v 1% lidského genomu pilotním projektem ENCODE“. Příroda. 447 (7146): 799–816. Bibcode:2007Natur.447..799B. doi:10.1038 / nature05874. PMC  2212820. PMID  17571346.
  17. ^ Karnani, N; Taylor, CM; Malhotra, A; Dutta, A (1. února 2010). „Genomická studie iniciace replikace v lidských chromozomech odhaluje vliv regulace transkripce a struktury chromatinu na výběr původu“. Molekulární biologie buňky. 21 (3): 393–404. doi:10.1091 / mbc.e09-08-0707. PMC  2814785. PMID  19955211.
  18. ^ Shibata, Y; Kumar, P; Layer, R; Willcox, S; Gagan, JR; Griffith, JD; Dutta, A (6. dubna 2012). „Extrachromozomální mikroDNA a chromozomální mikrodelece v normálních tkáních“. Věda. 336 (6077): 82–6. Bibcode:2012Sci ... 336 ... 82S. doi:10.1126 / science.1213307. PMC  3703515. PMID  22403181.
  19. ^ Kumar, P; Dillon, LW; Shibata, Y; Jazaeri, AA; Jones, DR; Dutta, A (září 2017). „Normální a rakovinové tkáně uvolňují do oběhu extrachromozomální kruhovou DNA (eccDNA)“. Výzkum molekulární rakoviny. 15 (9): 1197–1205. doi:10.1158 / 1541-7786.MCR-17-0095. PMC  5581709. PMID  28550083.
  20. ^ Lee, KY; Im, JS; Shibata, E; Dutta, A (5. října 2017). „ASF1a podporuje nehomologní opravu spojů na konci usnadněním fosforylace MDC1 pomocí ATM na dvojitých větvích“. Molekulární buňka. 68 (1): 61–75.e5. doi:10.1016 / j.molcel.2017.08.021. PMC  5743198. PMID  28943310.
  21. ^ Kiran, S; Dar, A; Singh, SK; Lee, KY; Dutta, A (6. prosince 2018). „Deubiquitináza USP46 je nezbytná pro šíření a růst nádorů u HPV transformovaných rakovin“. Molekulární buňka. 72 (5): 823–835.e5. doi:10.1016 / j.molcel.2018.09.019. PMC  6294304. PMID  30415951.
  22. ^ Mueller, AC; Cichewicz, MA; Dey, BK; Layer, R; Reon, BJ; Gagan, JR; Dutta, A (únor 2015). „MUNC, dlouhá nekódující RNA, která usnadňuje funkci MyoD v kosterní myogenezi“. Molekulární a buněčná biologie. 35 (3): 498–513. doi:10.1128 / MCB.01079-14. PMC  4285423. PMID  25403490.
  23. ^ Dey, BK; Pfeifer, K; Dutta, A (1. března 2014). „Dlouhá nekódující RNA H19 vede k vzniku mikroRNA miR-675-3p a miR-675-5p na podporu diferenciace a regenerace kosterního svalstva.“. Geny a vývoj. 28 (5): 491–501. doi:10,1101 / gad.234419.113. PMC  3950346. PMID  24532688.
  24. ^ Kim, HK; Lee, YS; Sivaprasad, U; Malhotra, A; Dutta, A (28. srpna 2006). „Svalová specifická mikroRNA miR-206 podporuje diferenciaci svalů“. The Journal of Cell Biology. 174 (5): 677–87. doi:10.1083 / jcb.200603008. PMC  2064311. PMID  16923828.
  25. ^ Lee, YS; Dutta, A (1. května 2007). „Nádorová supresorová mikroRNA let-7 potlačuje onkogen HMGA2“. Geny a vývoj. 21 (9): 1025–30. doi:10.1101 / gad.1540407. PMC  1855228. PMID  17437991.
  26. ^ Reon, BJ; Anaya, J; Zhang, Y; Mandell, J; Purow, B; Abounader, R; Dutta, A (prosinec 2016). „Exprese lncRNA v gliomech nízkého stupně a multiformním glioblastomu: analýza in Silico“. PLOS Medicine. 13 (12): e1002192. doi:10.1371 / journal.pmed.1002192. PMC  5140055. PMID  27923049.
  27. ^ Lee, YS; Shibata, Y; Malhotra, A; Dutta, A (15. listopadu 2009). „Nová třída malých RNA: fragmenty RNA odvozené od tRNA (tRF)“. Geny a vývoj. 23 (22): 2639–49. doi:10.1101 / gad.1837609. PMC  2779758. PMID  19933153.
  28. ^ Kumar, P; Kuscu, C; Dutta, A (srpen 2016). „Biogeneze a funkce fragmentů souvisejících s přenosovou RNA (tRF)“. Trendy v biochemických vědách. 41 (8): 679–689. doi:10.1016 / j.tibs.2016.05.004. PMC  5173347. PMID  27263052.
  29. ^ Kumar, P; Anaya, J; Mudunuri, SB; Dutta, A (1. října 2014). „Metaanalýza fragmentů RNA odvozených od tRNA ukazuje, že jsou evolučně konzervované a asociují se s proteiny AGO, aby rozpoznaly specifické cíle RNA“. Biologie BMC. 12: 78. doi:10.1186 / s12915-014-0078-0. PMC  4203973. PMID  25270025.

externí odkazy