Alexander Hoffmann - Alexander Hoffmann

Pro německého politika viz Alexander Hoffmann (politik).
Alexander Hoffmann
Alma materRockefellerova univerzita, Cambridge University
Vědecká kariéra
InstituceUniversity of California, Los Angeles
Doktorský poradceRobert G. Roeder
Ostatní akademičtí poradciDavid Baltimore

Alexander Hoffmann je americký biolog. Je ředitelem Institut pro kvantitativní a výpočetní biologické vědy (QCBio) a profesorem mikrobiologie Thomasem M Asherem na katedře mikrobiologie, imunologie a molekulární genetiky (MIMG) na University of California, Los Angeles (UCLA). Jeho výzkumným zájmem je vývoj prediktivního porozumění tomu, jak buněčné a molekulární sítě regulují imunitní odpovědi.[1]

Vzdělávání

Hoffmann získal bakalářský titul z fyziky a zoologie na Cambridge University v roce 1988 pokračování výzkumných projektů pod vedením John Gurdon a John Lasky. Získal titul Ph.D. v biochemii a molekulární biologii od Rockefellerova univerzita v roce 1994 pod dohledem Robert G. Roeder. Ve spolupráci s Roederem Hoffmann identifikoval geny kódující centrální transkripční faktor TFIID, včetně jeho podjednotky vázající DNA TATA-box vázající podjednotky.[2][3][4][5][6] Také vyvinul nyní populární systém výrazů His-tag,[7] což usnadňuje čištění rekombinantních proteinů.[8][9]

Kariéra

Hoffmann sledoval postdoktorský výzkum s David Baltimore na MIT od roku 1998 se zaměřením na transkripční kontrolu HIV a poté se v roce 1998 přestěhoval s Baltimorem do Caltechu. Na Caltech se zaměřil na transkripční[10] a signální funkce transkripčního faktoru imunitní odpovědi NF-kB, objevující jeho oscilační kontrolu.[11] Ve spolupráci s Andrem Levchenkem vyvinul Hoffmann matematický model, který vysvětlil molekulární základ pro komplexní dynamické řízení NF-kB.[12] Článek popisující tento model je považován za základní pro oblast buněčné signalizace.

Hoffmann založil Laboratoř signalizačních systémů v UCSD v roce 2003. Charakteristickým znakem jeho výzkumu je systémový biologický výzkumný přístup iterativního matematického modelování a experimentální analýzy a to, jak kinetická a dynamická kontrola molekulárních procesů propůjčuje specifičnost buněčným reakcím.[13][14] V roce 2009 spolu s Jeffem Hastym a Levem Tsimringem založil Institut pro biologické obvody UCSD.[15] V roce 2010 založil Centrum pro systémovou biologii v San Diegu, kde získal grant „Centrum excelence“ od Národní institut zdraví.[16] V roce 2013 zaujal pozici v UCLA V roce 2014 založil Institut pro kvantitativní a výpočetní biologické vědy (QCBio).[17]

Další role

Hoffmann podávaný s Pavel Pevzner jako spoluředitel postgraduálního programu UCSD v bioinformatice v letech 2009-2013, dohlíží na dramatický rozvoj a začleňování systémů biologie, biomedicínské informatiky a kvantitativní biologie[18]
Hoffmann pracoval na zlepšení spravedlnosti ve vzdělávacích příležitostech. Vedl vzdělávací terénní programy na Caltech (Young Engineering Science Scholars,[19] Nováček Letní institut[20]) a působil na UCSD ve výboru pro spravedlnost, rozmanitost a začlenění a jako předseda Rady pro rozmanitost kancléře se zaměřením na nábor a retenční postupy studentů a fakult a institucionální změny.

Reference

  1. ^ http://signalingsystems.ucla.edu
  2. ^ Hoffmann, A., Horikoshi, M., Wang, C. K., Schroeder, S., Weil, P.A., Roeder, R.G. 1990. Klonování genu TFIID Schizosaccharomyces pombe odhaluje silnou konzervaci funkčních domén přítomných v TFIID Saccharomyces cerevisiae. Genes & Development 4, str. 1141-1148
  3. ^ Hoffmann, A., Sinn, E., Yamamoto, T., Wang, J., Roy, A., Horikoshi, M., Roeder, R.G. 1990. Vysoce konzervovaná základní doména a jedinečný N-konec s předpokládanými regulačními motivy v lidském faktoru TATA (TFIID). Nature 346, č. 6282, str. 387-390
  4. ^ Gasch, A., Hoffmann, A., Horikoshi, M., Roeder, R.G., Chua, N.H. 1990. Arabidopsis thaliana obsahuje dva geny pro TFIID. Nature 346, č. 6282, str. 390-394
  5. ^ Hoffmann, A., Chiang, C.-M., Oelgeschläger, T., Burley, S.K., Nakatani, Y., Roeder, R.G. 1996 Struktura podobná histonovému oktameru v rámci TFIID. Nature 380, č. 6572, str. 356-359
  6. ^ Hoffmann, A., Oelgeschläger, T., Roeder, R.G. 1997 Úvahy o transkripčních kontrolních mechanismech: Rekapitulují komplexy promotoru TFIID-jádro funkce podobné nukleosomům? Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, str. 8928-8935
  7. ^ Hoffmann, A. a Roeder, R.G. 1991. Čištění his-značených proteinů v nedenaturačních podmínkách naznačuje vhodný způsob pro studie proteinových interakcí. Nucleic Acids Research 19, č. 22, str. 6337-6338
  8. ^ Nikolov, D.B., Hu, S.-H., Lin, J., Gasch, A., Hoffmann, A., Horikoshi, M., Chua, N.-H., Roeder, R.G., Burley, S.K. 1992. Krystalová struktura proteinu vázajícího TFIID TATA-box. Nature 360, str. 40-46
  9. ^ Xie, X.-L., Kokubo, T., Cohen, S., Mirza, U.A., Hoffmann, A., Chait, B.T., Roeder, R.G., Nakatani, Y., Burley, S.K. 1996 Strukturální podobnost mezi TAF a heterotetramerickým jádrem histonového oktameru. Nature 380, č. 6572, str. 316-322.
  10. ^ Hoffmann, A., Leung, T.H., Baltimore, D. 2003 Genetická analýza transkripčních faktorů NF-kB / Rel odhaluje molekulární specificity. EMBO J., 22, str. 5 530-9.
  11. ^ Hoffmann, A., Baltimore, D. 2006 Obvod signalizace NF-kB. Imunological Reviews, 210, str. 171-186. PMID  16623771
  12. ^ Hoffmann, A., Levchenko, A., Scott, M., Baltimore, D. 2002 Signalizační modul NF-B / IB: časová kontrola a selektivní genová aktivace. Science, 298, str. 1241-1245
  13. ^ Behar, M., Hoffmann, A. 2010 Dočasné kódy intracelulárních signálů. Current Opinion in Genetics and Development, 20, s. 684-693. PMID  20956081, PMC  2982931
  14. ^ Basak, S., Behar, M., Hoffmann, A. 2012 Poučení z matematického modelování dráhy NFκB. Imunological Reviews, 246, str. 211-38. PMID  22435558, PMC  3343698
  15. ^ http://biocircuits.ucsd.edu/
  16. ^ http://www.sdcsb.org
  17. ^ http://qcb.ucla.edu
  18. ^ http://bioinformatics.ucsd.edu
  19. ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 02.02.2015. Citováno 2018-10-10.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
  20. ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 2014-11-29. Citováno 2014-10-04.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)