ASD (databáze) - ASD (database)

AlloSteric databáze
Database.png
Obsah
PopisASD: komplexní databáze alosterických proteinů a modulátorů.
Kontakt
Výzkumné centrumLékařská fakulta Šanghajské univerzity Jiao Tong
LaboratořLaboratoř molekulárního designu, oddělení patofyziologie
Primární citacePMID  21051350
Datum vydání2012
Přístup
webová stránkamdl.ssmu.edu.cn/ ASD/

Allostery je nejpřímější a nejúčinnější způsob regulace biologických makromolekula funkce indukovaná vazbou a ligand opálení alosterická stránka topograficky odlišné od ortosterické místo. Kvůli vlastní vysoké receptorová selektivita a nižší toxicita na základě cíle se také očekává, že bude hrát pozitivnější roli při objevování drog a bioinženýrství, což vede k rychlému růstu alosterických nálezů.

Alosterická databáze (ASD)[1] poskytuje centrální zdroj pro zobrazení, vyhledávání a analýzu struktury, funkce a související anotace pro alosterické molekuly. V současné době ASD obsahuje alosterické proteiny z více než 100 druhů a modulátory ve třech kategoriích (aktivátory, inhibitory a regulátory). Každý protein je označen podrobným popisem allostery, biologického procesu a souvisejících chorob a každý modulátor je označen vazebná afinita, fyzikálně-chemické vlastnosti a terapeutická oblast. Integrace informací o alosterických proteinech do ASD by měla umožnit predikci alostery neznámých proteinů a nakonec z nich udělat ideální cíle pro experimentální validaci. Kromě toho mohou být modulátory kurátorované v ASD použity ke zkoumání silných alosterických cílů pro zkoumanou sloučeninu a také pomáhají chemikům implementovat úpravy struktury pro nové alosterické návrhy léků. ASD by proto mohla být platformou a výchozím bodem pro biologové a léčivé chemiky pro další alosterický výzkum.

Reference

  1. ^ Huang, Zhimin; Zhu Liang; Cao Yan; Wu Geng; Liu Xinyi; Chen Yingyi; Wang Qi; Shi Ting; Zhao Yaxue; Wang Yuefei; Li Weihua; Li Yixue; Chen Haifeng; Chen Guoqiang; Zhang Jian (leden 2011). „ASD: komplexní databáze alosterických proteinů a modulátorů“. Nucleic Acids Res. Anglie. 39 (Problém s databází): D663-9. doi:10.1093 / nar / gkq1022. PMC  3013650. PMID  21051350.

externí odkazy